izpis_h1_title_alt

SNPsyn : detection and exploration of SNP-SNP interactions
Curk, Tomaž (Avtor), Rot, Gregor (Avtor), Zupan, Blaž (Avtor)

URLURL - Predstavitvena datoteka, za dostop obiščite http://nar.oxfordjournals.org/content/39/suppl_2/W444.full.pdf+html Novo okno

Izvleček
SNPsyn (http://snpsyn.biolab.si) is an interactive software tool for the discovery of synergistic pairs of single nucleotide polymorphisms (SNPs) from large genome-wide case-control association studies (GWAS) data on complex diseases. Synergy among SNPs is estimated using an information-theoretic approach called interaction analysis. SNPsyn is both a stand-alone C++/Flash application and a web server. The computationally intensive part is implemented in C++ and can run in parallel on a dedicated cluster or grid. The graphical user interface is written in Adobe Flash Builder 4 and can run in most web browsers or as a stand-alone application. The SNPsyn web server hosts the Flash application, receives GWAS data submissions, invokes the interaction analysis and serves result files. The user can explore details on identified synergistic pairs of SNPs, perform gene set enrichment analysis and interact with the constructed SNP synergy network.

Jezik:Angleški jezik
Ključne besede:sinergija, GWAS, interakcije med polimorfizmi posameznih nukleotidov, SNP, teorija informacij
Vrsta gradiva:Delo ni kategorizirano (r6)
Tipologija:1.01 - Izvirni znanstveni članek
Organizacija:FRI - Fakulteta za računalništvo in informatiko
Leto izida:2011
Št. strani:str. 444-449
Številčenje:Vol. 39, suppl. 2
UDK:004.9:547
ISSN pri članku:0305-1048
COBISS.SI-ID:8352596 Povezava se odpre v novem oknu
Število ogledov:401
Število prenosov:99
Metapodatki:XML RDF-CHPDL DC-XML DC-RDF
 
Skupna ocena:(0 glasov)
Vaša ocena:Ocenjevanje je dovoljeno samo prijavljenim uporabnikom.
:
Objavi na: Bookmark and Share

Gradivo je del revije

Naslov:Nucleic acids research
Skrajšan naslov:Nucleic acids res.
Založnik:Oxford University Press
ISSN:0305-1048
COBISS.SI-ID:3269647 Novo okno

Sekundarni jezik

Jezik:Neznan jezik
Ključne besede:synergy, GWAS, interactions among single nucleotide polymophisms, SNP, information theory

Podobna dela

Podobna dela v RUL:
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:

Komentarji

Dodaj komentar

Za komentiranje se morate prijaviti.

Komentarji (0)
0 - 0 / 0
 
Ni komentarjev!

Nazaj