izpis_h1_title_alt

Solution-state structure of a long-loop G-quadruplex formed within promoters of Plasmodium falciparum B var genes
ID Juribašić Kulcsár, Marina (Avtor), ID Gabelica, Valérie (Avtor), ID Plavec, Janez (Avtor)

.pdfPDF - Predstavitvena datoteka, prenos (1,92 MB)
MD5: 023D286411C068E4B52B6A0E09753347
URLURL - Izvorni URL, za dostop obiščite https://chemistry-europe.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/chem.202401190 Povezava se odpre v novem oknu

Izvleček
We report the high-resolution NMR solution-state structure of an intramolecular G-quadruplex with a diagonal loop of ten nucleotides. The G-quadruplex is formed by a 34-nt DNA sequence, d[CAG$_3$T$_2$A$_2$G$_3$TATA$_2$CT$_3$AG$_4$T$_2$AG$_3$T$_2$], named UpsB-Q-1. This sequence is found within promoters of the var genes of Plasmodium falciparum, which play a key role in malaria pathogenesis and evasion of the immune system. The [3+1]-hybrid G-quadruplex formed under physiologically relevant conditions exhibits a unique equilibrium between two structures, both stabilized by base stacking and non-canonical hydrogen bonding. Unique equilibrium of the two closely related 3D structures originates from a North-South repuckering of deoxyribose moiety of residue T27 in the lateral loop. Besides the 12 guanines involved in three G-quartets, most residues in loop regions are involved in interactions at both G-quartet-loop interfaces.

Jezik:Angleški jezik
Ključne besede:G-quadruplex, nuclear magnetic resonance, long loop, loop interactions, Plasmodium falciparum
Vrsta gradiva:Članek v reviji
Tipologija:1.01 - Izvirni znanstveni članek
Organizacija:FKKT - Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo
Status publikacije:Objavljeno
Različica publikacije:Objavljena publikacija
Leto izida:2024
Št. strani:11 str.
Številčenje:Vol. 30, iss. 36, art. e202401190
PID:20.500.12556/RUL-159456 Povezava se odpre v novem oknu
UDK:577
ISSN pri članku:1521-3765
DOI:10.1002/chem.202401190 Povezava se odpre v novem oknu
COBISS.SI-ID:201336579 Povezava se odpre v novem oknu
Datum objave v RUL:10.07.2024
Število ogledov:288
Število prenosov:62
Metapodatki:XML DC-XML DC-RDF
:
Kopiraj citat
Objavi na:Bookmark and Share

Gradivo je del revije

Naslov:Chemistry : a European journal
Skrajšan naslov:Chemistry
Založnik:Wiley, Chemistry Europe
ISSN:1521-3765
COBISS.SI-ID:21813253 Povezava se odpre v novem oknu

Licence

Licenca:CC BY-NC 4.0, Creative Commons Priznanje avtorstva-Nekomercialno 4.0 Mednarodna
Povezava:http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/deed.sl
Opis:Licenca Creative Commons, ki prepoveduje komercialno uporabo, vendar uporabniki ne rabijo upravljati materialnih avtorskih pravic na izpeljanih delih z enako licenco.

Sekundarni jezik

Jezik:Slovenski jezik
Ključne besede:biokemija, g-kvadrupleksi, NMR, 3D strukture, malarija

Projekti

Financer:ARIS - Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:P1-0242
Naslov:Kemija in struktura bioloških učinkovin

Financer:Drugi - Drug financer ali več financerjev
Program financ.:CERIC-ERIC

Financer:Drugi - Drug financer ali več financerjev
Program financ.:Belgium, Wallonia-Brussels region

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:BI-BE/11-12-V-003

Podobna dela

Podobna dela v RUL:
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:

Nazaj