20.500.12556/RUL-94873 Metoda razvrščanja z združevanjem najbližjih sosedov v programu Orange Clustering by Neighbour Joining and its Implementation in Orange Metoda razvrščanja z združevanjem najbližjih sosedov gradi filogenetska drevesa iz matrike razdalj med objekti. Uporablja se v bioinformatiki za napovedovanje evolucijskih razmerij med biološkimi vrstami. Kljub uporabnosti na širšem področju aplikacij pa ta metoda le redkokdaj zaide med programe za odkrivanje znanj iz podatkov. V sklopu diplomske naloge smo zato to metodo implementirali v obliki gradnika v programu Orange. Razvili smo tudi nekaj metod vizualizacije zgrajenih filogenetskih dreves in te preizkusili na klasičnih podatkih s področja podatkovnega rudarjenja. Rezultati pričajo o uporabnosti metode izven področja bioinformatike. Neighbour joining builds phylogenetic trees from distance matrices. It is mainly used in bioinformatics for inference of evolutional relationships between species and prediction of common ancestors. Despite its usefulness in various applications it is rarely available in data mining programs. For this reason we implemented neighbour joining as a widget in general-purpose data mining suite Orange. We also developed several methods for visualisation of the inferred phylogenetic trees. Using our implementation on several use cases we have demonstrated that neighbour joining and constructed clustering trees are useful in data mining tasks outside the scope of bioinformatics. strojno učenje združevanje najbližjih sosedov bioinformatika Orange machine learning neighbour joining bioinformatics Orange true false false Slovenski jezik Angleški jezik Diplomsko delo/naloga 2017-09-08 12:59:49 2017-09-08 12:59:52 2022-08-10 02:01:33 0000-00-00 00:00:00 2017 0 0 0000-00-00 NiDoloceno NiDoloceno NiDoloceno 0000-00-00 0000-00-00 0000-00-00 1970-01-01 20062 Steblaj_Jurij_-_Metoda_razvrscanja_z_zdruzevanjem_najblizjih_sosedov_v_programu_Orange.pdf Steblaj_Jurij_-_Metoda_razvrscanja_z_zdruzevanjem_najblizjih_sosedov_v_programu_Orange.pdf 1 1102ABEE35ACFEB5DDF7B2C4D88FE262 e8d646bfd98ee31fe469a8c347a926a7caa55aa683f31c6895832b63122cc657 9e6902e9-a1b3-11eb-a523-00155dcfd717 20.500.12556/rul/81dc51ee-5638-4d52-8ed0-963a86165764 https://repozitorij.uni-lj.si/Dokument.php?lang=slv&id=103329 Fakulteta za računalništvo in informatiko 0 0 0