Zasnova translacije bioloških modelov v SBML zapisOSOLIN, TIMOTEJ (Avtor)
Moškon, Miha (Mentor)
Mraz, Miha (Komentor)
sistemska biologijaSysBioSBML zapisModelicatranslacijabiološki modeliSistemska biologija, kot pomemben člen v verigi številnih področij pri raziskovanju v medicini, uporablja poleg ostalih tehnik tudi kreiranje in urejanje raznovrstnih bioloških modelov. Pri tem tudi izkorišča prednosti objektno orientiranega modeliranja in programskih orodij, namenjenih izdelavi takih modelov. Na Univerzi v Ljubljani so tako razvili knjižnico, imenovano SysBio, kot pomoč pri ustvarjanju bioloških modelov. Za izdelavo knjižnice je bil uporabljen objektno orientiran Modelica programski jezik, ki pa je na področju sistemske biologije in njej sorodnih ved sorazmerno redek. Tako je za kompatibilnost z ostalimi, pogosteje uporabljenimi orodji, potrebna pretvorba v zapis, ki ga ta orodja podpirajo. Poznamo več različnih oblik zapisa, toda v sistemski biologiji je najbolj razširjen zapis SBML (angl. Systems Biology Markup Language). V pričujočem delu predstavimo razvoj programa, ki omogoča translacijo iz jezika Modelica v zapis SBML. Translacijo demonstriramo na enostavnem modelu metabolne poti, ki jo uspešno pretvorimo iz Modelica v SBML zapis.20162016-09-09 18:00:05Diplomsko delo/naloga85030VisID: 18581sl