<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<Gradivo ID="185464" NadgradivoID="4602" NRID="29018318" OceID="0" DomainUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/" IzpisPolniUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?lang=slv&amp;id=185464" StOgledov="38" StPrenosov="9" StOcen="0" VsotaOcen="0" DatumIzvoza="2026-08-11 08:57:09" OcenaSkupna="0" StPodgradiv="0" StudijskiProgramEvsID="" JeIndeksirano="0" JeVecAvtorjev="0" DovoliZahtevkeZaDostop="0">
  <PID Url="http://hdl.handle.net/20.500.12556/RUL-185464">20.500.12556/RUL-185464</PID>
  <Naslov>Multiscale imaging of Pleurotus ostreatus fruiting bodies – from 3D anatomy to the ultrastructure</Naslov>
  <Podnaslov></Podnaslov>
  <TujJezik_Naslov>Slikovna aAnaliza trosnjakov glive Pleurotus ostreatus – od 3D anatomije do ultrastrukture</TujJezik_Naslov>
  <TujJezik_Podnaslov></TujJezik_Podnaslov>
  <Opis>Oyster mushroom, Pleurotus ostreatus, is economically important and widely used as a model organism, yet a comprehensive characterisation of its fruiting body structure across multiple levels of biological organisation is lacking. We applied a  multiscale  imaging,  combining  micro-computed  tomography  (micro-CT),  light  microscopy of paraffin, cryostat and semithin sections, and transmission electron microscopy to investigate the structure of P. ostreatus young fruiting bodies, and we  provide  a  direct  comparison  of  different  sample  preparation  procedures.  Micro-CT enabled 3D anatomy visualisation, revealing distinct tissue regions: a loose  trama  in  the  stipe  and  pileus  medulla,  a  dense  peripheral  layer  of  pileus  and gills, and a thin, loose layer covering pileus and gills. Histological analyses provided detailed information on tissue organisation, complementing the micro-CT images, including hyphal arrangement, gill architecture, hymenial layer, and basidia. Cryosections preserved overall tissue morphology and proved suitable for  future  molecular  localisation  studies.  Transmission  electron  microscopy  of  Agar 100 and LR White embedded samples resolved the ultrastructure of hyphae and basidia, revealing nuclei, mitochondria, endoplasmic reticulum, vacuoles, cell walls, and dolipore septa with perforated pore cap. The study demonstrates the value of integrating imaging techniques to characterise the mushroom structure across scales and provides a toolbox for future investigations of fruiting bodies.</Opis>
  <TujJezik_Opis>Bukov ostrigar (Pleurotus ostreatus) je gospodarsko pomembna goba in pogosto uporabljen kot modelni organizem. Kljub temu je morfologija trosnjaka ostrigarja slabo opredeljena in podrobnih raziskav strukture na več ravneh biološke organizacije ni. V raziskavi smo uporabili kombinacijo slikovnih tehnik, in sicer mikro-računalniško tomografijo (mikro-CT),  svetlobno  mikroskopijo  parafinskih,  kriostatskih  in  poltankih  rezin  ter  presevno  elektronsko  mikroskopijo,  za  analizo strukture mladega trosnjaka vrste P. ostreatus. Poleg tega raziskava vključuje neposredno primerjavo različnih postopkov  priprave  vzorcev.  Tehnika  mikro-CT  je  omogočila  tridimenzionalno  vizualizacijo  anatomije  trosnjakov  in  prikazala različna tkivna območja: rahlo tkivo v betu in sredici klobuka, gosta robna plast klobuka in lističev ter tanko rahlo plast, ki prekriva klobuk in lističe. S histološko analizo smo podrobno pokazali organizacijo tkiv, kar dopolnjuje rezultate iz mikro-CT analiz, vključno z razporeditvijo hif, arhitekturo lističev, trosovnice in bazidijev. Kriostatske rezine so podale splošno morfologijo tkiva, primerno za nadaljnje študije molekularne lokalizacije. S presevno elektronsko mikroskopijo vzorcev vklopljenih v smolo Agar 100 in v smolo LR White smo pokazali ultrastrukturo hif in bazidijev, vidna  so  bila  jedra,  mitohondriji,  endoplazemski  retikulum,  vakuole,  celične  stene  in  doliporne  septe  s  perforirano  porno  kapico.  Raziskava  kaže  pomen  integracije  slikovnih  tehnik,  s  katerimi  lahko  opredelimo  strukturo  gobe  na  različnih prostorskih ravneh, in zagotavlja orodje za prihodnje raziskave trosnjakov. </TujJezik_Opis>
  <KljucneBesede>
    <Beseda>micro-CT</Beseda>
    <Beseda>microscopy</Beseda>
    <Beseda>fungi</Beseda>
    <Beseda>hyphae</Beseda>
    <Beseda>cell wall</Beseda>
    <Beseda>septal pore</Beseda>
  </KljucneBesede>
  <TujJezik_KljucneBesede>
    <Beseda>mikro-CT</Beseda>
    <Beseda>mikroskopija</Beseda>
    <Beseda>glive</Beseda>
    <Beseda>hife</Beseda>
    <Beseda>celična stena</Beseda>
    <Beseda>septalna pora</Beseda>
  </TujJezik_KljucneBesede>
  <Potrjeno>true</Potrjeno>
  <JeZaklenjeno>false</JeZaklenjeno>
  <JeRecenzirano>true</JeRecenzirano>
  <Zaloznik></Zaloznik>
  <Izvor></Izvor>
  <Jezik ID="1033" ISO639-3="eng">Angleški jezik</Jezik>
  <TujJezik ID="1060" ISO639-3="slv">Slovenski jezik</TujJezik>
  <Povezave></Povezave>
  <Pokrivanje></Pokrivanje>
  <CasovnoPokritje></CasovnoPokritje>
  <AvtorskePravice></AvtorskePravice>
  <VrstaGradiva ID="dk_c" DRIVER="info:eu-repo/semantics/article">Članek v reviji</VrstaGradiva>
  <DatumVstavljanja>2026-08-06 08:46:50</DatumVstavljanja>
  <DatumObjave>2026-08-06 08:46:51</DatumObjave>
  <DatumSpremembe>2026-08-07 04:08:22</DatumSpremembe>
  <DatumTrajnegaHranjenja>0000-00-00 00:00:00</DatumTrajnegaHranjenja>
  <LetoIzida>2026</LetoIzida>
  <LetoIzidaDo>0</LetoIzidaDo>
  <KrajIzida></KrajIzida>
  <LetoIzvedbe>0</LetoIzvedbe>
  <KrajIzvedbe></KrajIzvedbe>
  <Opomba></Opomba>
  <StStrani>Str. 64-86</StStrani>
  <StevilcenjeNivo1>no. 3</StevilcenjeNivo1>
  <StevilcenjeNivo2>Vol. 69</StevilcenjeNivo2>
  <Kronologija>2026</Kronologija>
  <Patent_Stevilka></Patent_Stevilka>
  <Patent_DatumVeljavnosti>0000-00-00</Patent_DatumVeljavnosti>
  <VerzijaDokumenta>Zaloznikova</VerzijaDokumenta>
  <StatusObjaveDrugje>Objavljeno</StatusObjaveDrugje>
  <VrstaStroskaObjave>NiDoloceno</VrstaStroskaObjave>
  <DatumPoslanoVRecenzijo>0000-00-00</DatumPoslanoVRecenzijo>
  <DatumSprejetjaClanka>0000-00-00</DatumSprejetjaClanka>
  <DatumObjaveClanka>0000-00-00</DatumObjaveClanka>
  <Licence>
    <Licenca ID="5" Kratica="CC BY-SA 4.0" Naziv="Creative Commons Priznanje avtorstva-Deljenje pod enakimi pogoji 4.0 Mednarodna" URL="http://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/deed.sl" Logo="by-sa.png" LogoPolniUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/teme/rulDev/img/licence/by-sa.png" DatumZacetkaLicenciranja="" VezanoNa="" VezanoNaAng="" Besedilo="" BesediloAng=""></Licenca>
  </Licence>
  <EmbargoDo></EmbargoDo>
  <VrstaEmbarga ID="1" Naziv="Takojšnja javna objava" OpenAIREDostop="openAccess"></VrstaEmbarga>
  <Osebe>
    <Oseba ID="15315" Ime="Polona" Priimek="Mrak" AltIme="P. Mrak" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="130731875" Afiliacija="" ArrsID="33923" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="163499" Ime="Jacopo" Priimek="Conti" AltIme="" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="458248963" Afiliacija="" ArrsID="" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="36006" Ime="Urban" Priimek="Bogataj" AltIme="U. Bogataj" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="239043683" Afiliacija="" ArrsID="38158" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="96435" Ime="Matej" Priimek="Skočaj" AltIme="M. Skočaj; Matej Skocaj" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="113617763" Afiliacija="" ArrsID="33137" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="15308" Ime="Rok" Priimek="Kostanjšek" AltIme="R. Kostanjšek; R. Kostanjsek; Rok Konstanjšek; Rok Kotanjšek" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="4684643" Afiliacija="" ArrsID="18749" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="35072" Ime="Nada" Priimek="Žnidaršič" AltIme="N. Žnidaršič; N. Znidarsic; Nada Znidarsic" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="4421987" Afiliacija="" ArrsID="16381" ORCID=""></Oseba>
  </Osebe>
  <Identifikatorji>
    <Identifikator ID="4" Sifra="UDK" Naziv="UDK" URL="">543.456</Identifikator>
    <Identifikator ID="9" Sifra="ISSN-clanka" Naziv="ISSN pri članku" URL="">1854-3073</Identifikator>
    <Identifikator ID="15" Sifra="DOI" Naziv="DOI" URL="http://dx.doi.org/10.14720/abs.69.3.28176">10.14720/abs.69.3.28176</Identifikator>
    <Identifikator ID="3" Sifra="CobissID" Naziv="COBISS_ID" URL="https://plus.cobiss.net/cobiss/si/sl/bib/286891523">286891523</Identifikator>
  </Identifikatorji>
  <Datoteke>
    <Datoteka ID="243979" DatotekaNRID="14753118" NamenDatotekeID="2" NamenDatoteke="Predstavitvena datoteka" FormatDatotekeID="2" FormatDatoteke=".pdf" MIME="application/pdf" IkonaFormata="pdf.png" IkonaFormataPolniUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/teme/rulDev/img/fileTypes/pdf.png" VelikostDatoteke="4855974" VelikostDatotekeKratko="4,63 MB" DatumVstavljanja="2026-08-06 08:48:30" JeZbrisana="false" JeJavnoVidna="true" JeIndeksirana="true" JeVidno="true" VidnoOd="01.01.1970" Zaporedje="0">
      <Naziv>RAZ_Mrak_Polona_2026.pdf</Naziv>
      <OrgNaziv>RAZ_Mrak_Polona_2026.pdf</OrgNaziv>
      <URL></URL>
      <Opis></Opis>
      <OpisTujJezik></OpisTujJezik>
      <UrlObdelave></UrlObdelave>
      <FrekvencaAzuriranjaID>1</FrekvencaAzuriranjaID>
      <Verzija></Verzija>
      <MD5>36EAB399B5806A57CFBFFFDF879218AD</MD5>
      <SHA256>748c047d91f75c32d3218cd38632b07666576828803123a950a0def3fa7b104a</SHA256>
      <UUID>7d9a734e-9162-11f1-9b0d-0050569b8976</UUID>
      <PID></PID>
      <PrenosPolniUrl>https://repozitorij.uni-lj.si/Dokument.php?lang=slv&amp;id=243979</PrenosPolniUrl>
      <Vsebine>
        <Vsebina TipVsebine="GoloBesedilo" JezikID="1033" Oznaka="" Dolzina="78384"></Vsebina>
      </Vsebine>
    </Datoteka>
    <Datoteka ID="243980" DatotekaNRID="0" NamenDatotekeID="5" NamenDatoteke="Izvorni URL" FormatDatotekeID="56" FormatDatoteke="URL" MIME="text/url" IkonaFormata="url.png" IkonaFormataPolniUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/teme/rulDev/img/fileTypes/url.png" VelikostDatoteke="0" VelikostDatotekeKratko="0,00 KB" DatumVstavljanja="2026-08-06 08:48:49" JeZbrisana="false" JeJavnoVidna="true" JeIndeksirana="false" JeVidno="true" VidnoOd="01.01.1970" Zaporedje="2">
      <Naziv></Naziv>
      <OrgNaziv></OrgNaziv>
      <URL>https://journals.uni-lj.si/abs/article/view/28176</URL>
      <Opis></Opis>
      <OpisTujJezik></OpisTujJezik>
      <UrlObdelave></UrlObdelave>
      <FrekvencaAzuriranjaID>0</FrekvencaAzuriranjaID>
      <Verzija></Verzija>
      <MD5></MD5>
      <SHA256></SHA256>
      <UUID>88c53e6e-9162-11f1-9b0d-0050569b8976</UUID>
      <PID></PID>
      <PrenosPolniUrl>https://repozitorij.uni-lj.si/Dokument.php?lang=slv&amp;id=243980</PrenosPolniUrl>
      <Vsebine>
      </Vsebine>
    </Datoteka>
  </Datoteke>
  <Organizacije>
    <Organizacija OrganizacijaID="5" Kratica="BF" ZavodEvsID="0000057" Logo="" LogoPolniUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/teme/rulDev/img/logo/">Biotehniška fakulteta </Organizacija>
  </Organizacije>
  <OrganizacijeVira>
  </OrganizacijeVira>
  <MetodeZbiranjaPodatkov>
  </MetodeZbiranjaPodatkov>
  <TipologijaDela ID="1.01" Koda="1.01" Naziv="Izvirni znanstveni članek" SchemaOrg="Article"></TipologijaDela>
  <OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/ARIS//P1-0184-2020" Stevilka="P1-0184-2020" Naslov="Integrativna zoologija in speleobiologija" Akronim="" Delez="50"></OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/ARIS//I0-0022-0481-0481-07" Stevilka="I0-0022-0481-0481-07" Naslov="IC Mikroskopija bioloških vzorcev" Akronim="ICMBV" Delez="50"></OpenAIRE>
  </OpenAIRE>
  <Ostalo>
    <StIrodsDatotek>0</StIrodsDatotek>
    <StDatotekPodTrajnimEmbargom>0</StDatotekPodTrajnimEmbargom>
    <StDatotekZOmejenimDostopom>0</StDatotekZOmejenimDostopom>
  </Ostalo>
</Gradivo>
