<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<Gradivo ID="183982" NadgradivoID="3473" NRID="28807620" OceID="0" DomainUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/" IzpisPolniUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?lang=slv&amp;id=183982" StOgledov="203" StPrenosov="144" StOcen="0" VsotaOcen="0" DatumIzvoza="2026-09-28 22:02:25" OcenaSkupna="0" StPodgradiv="0" StudijskiProgramEvsID="" JeIndeksirano="0" JeVecAvtorjev="0" DovoliZahtevkeZaDostop="0">
  <PID Url="http://hdl.handle.net/20.500.12556/RUL-183982">20.500.12556/RUL-183982</PID>
  <Naslov>Optimizing in vitro efficacy assessment of the antisense oligonucleotide nusinersen in human cellular models</Naslov>
  <Podnaslov></Podnaslov>
  <TujJezik_Naslov></TujJezik_Naslov>
  <TujJezik_Podnaslov></TujJezik_Podnaslov>
  <Opis>Background/Objectives: Spinal muscular atrophy (SMA) is a rare genetic disorder caused by mutations or deletions in SMN1, resulting in the loss of SMN protein and severe neuromuscular consequences. Nusinersen, an antisense oligonucleotide that promotes full-length SMN2 transcript formation, has significantly improved SMA outcomes. However, standardized in vitro procedures for evaluating nusinersen efficacy remain limited. This study aimed to optimize in vitro efficacy assessment of nusinersen across two human cellular models. 
Methods: Experiments were performed using HEK293 cells and the SMA patient-derived fibroblast line GM03813. Transfection conditions were optimized for each model. In HEK293 cells, several seeding densities were evaluated for nucleofection, while in GM03813 fibroblasts, multiple transfection reagents and protocols were tested. Nusinersen activity was quantified at the transcript and protein levels, and dose–response curves were generated to determine EC50 values. 
Results: In HEK293 cells, a higher seeding density (1 × 106 cells) yielded the most efficient nucleofection. In GM03813 fibroblasts, Lipofectamine 3000 outperformed the other transfection reagents tested. Nusinersen exhibited dose-dependent effects in both models. The EC50 for transcript induction in HEK293 cells was 293 nM, whereas in GM03813 fibroblasts the EC50 was 10 nM, demonstrating substantial model-dependent differences in response. 
Conclusions: This study establishes optimized conditions for in vitro efficacy assessment of nusinersen in HEK293 and GM03813 cellular models. These protocols provide a robust and reproducible framework for evaluating nusinersen and can be readily applied to other antisense oligonucleotides designed to correct SMN2 splicing.</Opis>
  <TujJezik_Opis></TujJezik_Opis>
  <KljucneBesede>
    <Beseda>nusinersen</Beseda>
    <Beseda>spinal muscular atrophy</Beseda>
    <Beseda>survival of motor neuron</Beseda>
    <Beseda>SMN</Beseda>
    <Beseda>antisense oligonucleotides</Beseda>
    <Beseda>drug validation</Beseda>
  </KljucneBesede>
  <TujJezik_KljucneBesede>
    <Beseda>spinalna mišična atrofija</Beseda>
    <Beseda>gen za preživetje motoričnih nevronov</Beseda>
    <Beseda>protismerni oligonukleotidi</Beseda>
    <Beseda>validacija zdravil</Beseda>
  </TujJezik_KljucneBesede>
  <Potrjeno>true</Potrjeno>
  <JeZaklenjeno>false</JeZaklenjeno>
  <JeRecenzirano>true</JeRecenzirano>
  <Zaloznik></Zaloznik>
  <Izvor></Izvor>
  <Jezik ID="1033" ISO639-3="eng">Angleški jezik</Jezik>
  <TujJezik ID="1060" ISO639-3="slv">Slovenski jezik</TujJezik>
  <Povezave></Povezave>
  <Pokrivanje></Pokrivanje>
  <CasovnoPokritje></CasovnoPokritje>
  <AvtorskePravice></AvtorskePravice>
  <VrstaGradiva ID="dk_c" DRIVER="info:eu-repo/semantics/article">Članek v reviji</VrstaGradiva>
  <DatumVstavljanja>2026-06-23 11:02:34</DatumVstavljanja>
  <DatumObjave>2026-06-23 11:02:41</DatumObjave>
  <DatumSpremembe>2026-08-11 08:13:13</DatumSpremembe>
  <DatumTrajnegaHranjenja>0000-00-00 00:00:00</DatumTrajnegaHranjenja>
  <LetoIzida>2026</LetoIzida>
  <LetoIzidaDo>0</LetoIzidaDo>
  <KrajIzida></KrajIzida>
  <LetoIzvedbe>0</LetoIzvedbe>
  <KrajIzvedbe></KrajIzvedbe>
  <Opomba></Opomba>
  <StStrani>18 str. </StStrani>
  <StevilcenjeNivo1>iss. 6, art.  652</StevilcenjeNivo1>
  <StevilcenjeNivo2>Vol. 18</StevilcenjeNivo2>
  <Kronologija>May 2026</Kronologija>
  <Patent_Stevilka></Patent_Stevilka>
  <Patent_DatumVeljavnosti>0000-00-00</Patent_DatumVeljavnosti>
  <VerzijaDokumenta>Zaloznikova</VerzijaDokumenta>
  <StatusObjaveDrugje>Objavljeno</StatusObjaveDrugje>
  <VrstaStroskaObjave>NiDoloceno</VrstaStroskaObjave>
  <DatumPoslanoVRecenzijo>0000-00-00</DatumPoslanoVRecenzijo>
  <DatumSprejetjaClanka>0000-00-00</DatumSprejetjaClanka>
  <DatumObjaveClanka>0000-00-00</DatumObjaveClanka>
  <Licence>
    <Licenca ID="6" Kratica="CC BY 4.0" Naziv="Creative Commons Priznanje avtorstva 4.0 Mednarodna" URL="http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/deed.sl" Logo="by.png" LogoPolniUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/teme/rulDev/img/licence/by.png" DatumZacetkaLicenciranja="" VezanoNa="" VezanoNaAng="" Besedilo="" BesediloAng=""></Licenca>
  </Licence>
  <EmbargoDo></EmbargoDo>
  <VrstaEmbarga ID="1" Naziv="Takojšnja javna objava" OpenAIREDostop="openAccess"></VrstaEmbarga>
  <Osebe>
    <Oseba ID="30877" Ime="Maša" Priimek="Sinreih" AltIme="M. Sinreih; Maa Sinreih; Masa Sinreih; Ma?a Sinreih; M Sinreih; Maša Sinreih Tisnikar; Maša Sinreih Tisnikar" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="203394915" Afiliacija="" ArrsID="34259" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="105347" Ime="Alja" Priimek="Zottel" AltIme="A Zottel;  Zottel; A. Zottel; Alja Zottler" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="238199139" Afiliacija="" ArrsID="39126" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="54542" Ime="Katja" Priimek="Kristan" AltIme="" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="14341219" Afiliacija="" ArrsID="24392" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="15576" Ime="Tea" Priimek="Lanišnik-Rižner" AltIme="Tea Lanišnik- Rizner; Tea Lanišnik Rižner; Tea Lanišnik- Rižner; Tea Lanišnik-Rizner; Tea Lanišnik Rižner; Tea Lanišnik; T. Lanisnik Rizner; T. Rizner Lanisnik; T. Lanisnik Rizner; T. Lanišnik Rižner; T. Rižner Lanišnik; T. Lanišnik Rižner; T Lanišnik Rizner; T Rizner Lanišnik; T Lanišnik Rizner; T. Laninik Riner; T. Laninik Riner; Tea Laninik Riner; Tea Laninik Riner; Tea Lanisnik Rizner; Tea Lanisnik Rizner; TL Rizner; Tea Lani?nik Ri?ner; Tea Lani?nik Ri?ner; Tea Ri?ner; T Lanišnik Rižner; T Lanišnik Rižner; Tea Lanisnik Rinzer; Tea Lanisnik Rinzer; Tea Lanišnik Rizner; Tea Lanišnik Rizner" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="3543139" Afiliacija="" ArrsID="11699" ORCID=""></Oseba>
  </Osebe>
  <Identifikatorji>
    <Identifikator ID="4" Sifra="UDK" Naziv="UDK" URL="">577:615</Identifikator>
    <Identifikator ID="9" Sifra="ISSN-clanka" Naziv="ISSN pri članku" URL="">1999-4923</Identifikator>
    <Identifikator ID="15" Sifra="DOI" Naziv="DOI" URL="http://dx.doi.org/10.3390/pharmaceutics18060652">10.3390/pharmaceutics18060652</Identifikator>
    <Identifikator ID="3" Sifra="CobissID" Naziv="COBISS_ID" URL="https://plus.cobiss.net/cobiss/si/sl/bib/280630019">280630019</Identifikator>
  </Identifikatorji>
  <Datoteke>
    <Datoteka ID="236336" DatotekaNRID="14720596" NamenDatotekeID="2" NamenDatoteke="Predstavitvena datoteka" FormatDatotekeID="2" FormatDatoteke=".pdf" MIME="application/pdf" IkonaFormata="pdf.png" IkonaFormataPolniUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/teme/rulDev/img/fileTypes/pdf.png" VelikostDatoteke="1990378" VelikostDatotekeKratko="1,90 MB" DatumVstavljanja="2026-06-23 11:05:40" JeZbrisana="false" JeJavnoVidna="true" JeIndeksirana="true" JeVidno="true" VidnoOd="01.01.1970" Zaporedje="0">
      <Naziv>RAZ_Sinreih_Masa_2026.pdf</Naziv>
      <OrgNaziv>RAZ_Sinreih_Masa_2026.pdf</OrgNaziv>
      <URL></URL>
      <Opis></Opis>
      <OpisTujJezik></OpisTujJezik>
      <UrlObdelave></UrlObdelave>
      <FrekvencaAzuriranjaID>1</FrekvencaAzuriranjaID>
      <Verzija></Verzija>
      <MD5>F911909FB60BA7CFA54E0AB136E44AA1</MD5>
      <SHA256>8bc5d82159e01ba4eab6774dd23ec82ee50b65bfb4cf2ea50e930cd7bb6cd7a8</SHA256>
      <UUID>9fc1100c-6ee2-11f1-9b0d-0050569b8976</UUID>
      <PID></PID>
      <PrenosPolniUrl>https://repozitorij.uni-lj.si/Dokument.php?lang=slv&amp;id=236336</PrenosPolniUrl>
      <Vsebine>
        <Vsebina TipVsebine="GoloBesedilo" JezikID="1033" Oznaka="" Dolzina="60694"></Vsebina>
      </Vsebine>
    </Datoteka>
    <Datoteka ID="236335" DatotekaNRID="0" NamenDatotekeID="5" NamenDatoteke="Izvorni URL" FormatDatotekeID="56" FormatDatoteke="URL" MIME="text/url" IkonaFormata="url.png" IkonaFormataPolniUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/teme/rulDev/img/fileTypes/url.png" VelikostDatoteke="0" VelikostDatotekeKratko="0,00 KB" DatumVstavljanja="2026-06-23 11:02:43" JeZbrisana="false" JeJavnoVidna="true" JeIndeksirana="false" JeVidno="true" VidnoOd="01.01.1970" Zaporedje="1">
      <Naziv></Naziv>
      <OrgNaziv></OrgNaziv>
      <URL>https://www.mdpi.com/1999-4923/18/6/652</URL>
      <Opis></Opis>
      <OpisTujJezik></OpisTujJezik>
      <UrlObdelave></UrlObdelave>
      <FrekvencaAzuriranjaID>1</FrekvencaAzuriranjaID>
      <Verzija></Verzija>
      <MD5></MD5>
      <SHA256></SHA256>
      <UUID>361acd94-6ee2-11f1-9b0d-0050569b8976</UUID>
      <PID></PID>
      <PrenosPolniUrl>https://repozitorij.uni-lj.si/Dokument.php?lang=slv&amp;id=236335</PrenosPolniUrl>
      <Vsebine>
      </Vsebine>
    </Datoteka>
  </Datoteke>
  <Organizacije>
    <Organizacija OrganizacijaID="18" Kratica="MF" ZavodEvsID="0000072" Logo="" LogoPolniUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/teme/rulDev/img/logo/">Medicinska fakulteta </Organizacija>
  </Organizacije>
  <OrganizacijeVira>
  </OrganizacijeVira>
  <MetodeZbiranjaPodatkov>
  </MetodeZbiranjaPodatkov>
  <TipologijaDela ID="1.01" Koda="1.01" Naziv="Izvirni znanstveni članek" SchemaOrg="Article"></TipologijaDela>
  <OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="" Stevilka="" Naslov="" Akronim="" Delez="0"></OpenAIRE>
  </OpenAIRE>
  <Ostalo>
    <StIrodsDatotek>0</StIrodsDatotek>
    <StDatotekPodTrajnimEmbargom>0</StDatotekPodTrajnimEmbargom>
    <StDatotekZOmejenimDostopom>0</StDatotekZOmejenimDostopom>
  </Ostalo>
</Gradivo>
