<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<Gradivo ID="183193" NadgradivoID="7372" NRID="28722745" OceID="0" DomainUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/" IzpisPolniUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?lang=slv&amp;id=183193" StOgledov="79" StPrenosov="32" StOcen="0" VsotaOcen="0" DatumIzvoza="2026-06-16 00:26:41" OcenaSkupna="0" StPodgradiv="0" StudijskiProgramEvsID="" JeIndeksirano="0" JeVecAvtorjev="0" DovoliZahtevkeZaDostop="0">
  <PID Url="http://hdl.handle.net/20.500.12556/RUL-183193">20.500.12556/RUL-183193</PID>
  <Naslov>Emerging human pathogen</Naslov>
  <Podnaslov>identifying Spiroplasma ixodetis as a frequent cause of unlocalised febrile illness</Podnaslov>
  <TujJezik_Naslov></TujJezik_Naslov>
  <TujJezik_Podnaslov></TujJezik_Podnaslov>
  <Opis>Objectives: Febrile illness without clear localisation presents a significant diagnostic challenge due to nonspecific symptoms and diverse aetiologies. Spiroplasma ixodetis, an emerging tick-associated pathogen previously linked mainly to congenital cataracts, has not been well characterised in adults. We investigated the prevalence and clinical features of S. ixodetis infection in adults with acute febrile illness without localisation.
Methods: Shotgun metagenomic sequencing identified S. ixodetis in the initial 209 patient cohort and the sequences were used to developed a novel real-time PCR assay targeting the 23S rRNA gene. Initial cohort screening was followed by testing 128 patients from an additionally selected targeted cohort. Positive results were confirmed by sequencing of 16S and 23S rRNA genes.
Results: S. ixodetis DNA was confirmed in 7.2% patients from the initial and in 35.2% patients from the additional cohort (60 in total). All were identified in the period from April to October and 57% reported a recent tick-bite. Clinical presentation was homogenous, characterised by fever, headache, bicytopenia and liver enzyme abnormalities. Outcomes were favourable, with 15% requiring hospitalisation.
Conclusion: This study identifies S. ixodetis as a previously unrecognised cause of adult febrile illness without localisation, bridging the gap between previously published data between tick studies and isolated human case reports.</Opis>
  <TujJezik_Opis></TujJezik_Opis>
  <KljucneBesede>
    <Beseda>23S rRNA PCR</Beseda>
    <Beseda>fever</Beseda>
    <Beseda>metagenomics</Beseda>
    <Beseda>patients</Beseda>
    <Beseda>Spiroplasma ixodetis</Beseda>
    <Beseda>tick-borne diseases</Beseda>
  </KljucneBesede>
  <TujJezik_KljucneBesede>
    <Beseda>23S rRNA PCR</Beseda>
    <Beseda>vročina</Beseda>
    <Beseda>metagenomika</Beseda>
    <Beseda>bolniki</Beseda>
    <Beseda>Spiroplasma ixodetis</Beseda>
    <Beseda>klopne bolezni</Beseda>
  </TujJezik_KljucneBesede>
  <Potrjeno>true</Potrjeno>
  <JeZaklenjeno>false</JeZaklenjeno>
  <JeRecenzirano>true</JeRecenzirano>
  <Zaloznik></Zaloznik>
  <Izvor></Izvor>
  <Jezik ID="1033" ISO639-3="eng">Angleški jezik</Jezik>
  <TujJezik ID="1060" ISO639-3="slv">Slovenski jezik</TujJezik>
  <Povezave></Povezave>
  <Pokrivanje></Pokrivanje>
  <CasovnoPokritje></CasovnoPokritje>
  <AvtorskePravice></AvtorskePravice>
  <VrstaGradiva ID="dk_c" DRIVER="info:eu-repo/semantics/article">Članek v reviji</VrstaGradiva>
  <DatumVstavljanja>2026-06-07 07:36:24</DatumVstavljanja>
  <DatumObjave>2026-06-07 07:36:24</DatumObjave>
  <DatumSpremembe>2026-06-08 08:23:41</DatumSpremembe>
  <DatumTrajnegaHranjenja>0000-00-00 00:00:00</DatumTrajnegaHranjenja>
  <LetoIzida>2026</LetoIzida>
  <LetoIzidaDo>0</LetoIzidaDo>
  <KrajIzida></KrajIzida>
  <LetoIzvedbe>0</LetoIzvedbe>
  <KrajIzvedbe></KrajIzvedbe>
  <Opomba></Opomba>
  <StStrani>9 str. </StStrani>
  <StevilcenjeNivo1>iss. 1, art. 106776</StevilcenjeNivo1>
  <StevilcenjeNivo2>Vol. 93</StevilcenjeNivo2>
  <Kronologija>May 2026</Kronologija>
  <Patent_Stevilka></Patent_Stevilka>
  <Patent_DatumVeljavnosti>0000-00-00</Patent_DatumVeljavnosti>
  <VerzijaDokumenta>Zaloznikova</VerzijaDokumenta>
  <StatusObjaveDrugje>Objavljeno</StatusObjaveDrugje>
  <VrstaStroskaObjave>NiDoloceno</VrstaStroskaObjave>
  <DatumPoslanoVRecenzijo>0000-00-00</DatumPoslanoVRecenzijo>
  <DatumSprejetjaClanka>0000-00-00</DatumSprejetjaClanka>
  <DatumObjaveClanka>0000-00-00</DatumObjaveClanka>
  <Licence>
    <Licenca ID="1" Kratica="CC BY-NC-ND 4.0" Naziv="Creative Commons Priznanje avtorstva-Nekomercialno-Brez predelav 4.0 Mednarodna" URL="http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.sl" Logo="by-nc-nd.eu.png" LogoPolniUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/teme/rulDev/img/licence/by-nc-nd.eu.png" DatumZacetkaLicenciranja="" VezanoNa="" VezanoNaAng="" Besedilo="" BesediloAng=""></Licenca>
  </Licence>
  <EmbargoDo></EmbargoDo>
  <VrstaEmbarga ID="1" Naziv="Takojšnja javna objava" OpenAIREDostop="openAccess"></VrstaEmbarga>
  <Osebe>
    <Oseba ID="61880" Ime="Miša" Priimek="Korva" AltIme="Misa Korva; M Korva; M. Korva" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="121524067" Afiliacija="" ArrsID="30696" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="61885" Ime="Petra" Priimek="Bogovič" AltIme="Petra Bogovic; P. Bogovič; P Bogovič; Perta Bogovič; P. Bogovic" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="97725283" Afiliacija="" ArrsID="27886" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="105883" Ime="Nataša" Priimek="Knap" AltIme="N. Knap; Natasa Knap; Nataša Knap Gašper; Nataša Knap Gašper; N. Knap Gašper" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="23995747" Afiliacija="" ArrsID="28601" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="61899" Ime="Rok" Priimek="Kogoj" AltIme="R Kogoj mikrobiologija; R. Kogoj" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="84530275" Afiliacija="" ArrsID="29937" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="111197" Ime="Jan" Priimek="Slunečko" AltIme="J. Slunečko" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="321324899" Afiliacija="" ArrsID="55839" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="108976" Ime="Samo" Priimek="Zakotnik" AltIme="S. Zakotnik" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="256428131" Afiliacija="" ArrsID="51960" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="55229" Ime="Alen" Priimek="Suljič" AltIme="Alen Suljic; A. Suljič" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="252168291" Afiliacija="" ArrsID="52539" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="105309" Ime="Katarina" Priimek="Resman Rus" AltIme="Katarina Resman; Katarina Resman Rus; K. Resman Rus; K. Resman Rus; K Resman Rus; K Resman Rus" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="201088355" Afiliacija="" ArrsID="35044" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="160685" Ime="Patricija" Priimek="Pozvek" AltIme="P. Pozvek" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="415483651" Afiliacija="" ArrsID="59757" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="61837" Ime="Franc" Priimek="Strle" AltIme="Franci Strle; Franz Strle; F. Strle; F Strle; Franc Sterle" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="3833955" Afiliacija="" ArrsID="13301" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="1505" Ime="Tatjana" Priimek="Avšič-Županc" AltIme="Tatjana Avšič- Županc; Tatjana Avšič Županc; T. Avšič-Županc; T. Avšič- Županc; Tatjana Avšič; Tatjana Avšič Županc; Tatjana Avsic-Zupanc; Tatjana Zupanc- Avsic; Tatjana Avsic- Zupanc; T. Avsic Zupanc; T. Zupanc Avsic; T. Avsic Zupanc; Tatjana Avsic Zupanac; Tatjana Avsic Zupanac; Tatjana Zupanac Avsic; Tatjana Avsic Zupanc; Tatjana Zupanc Avsic; Tatjana Avsic Zupanc; T Avšić-Županc; T Županc- Avšić; T Avšić- Županc; T Avsic Zupanc; T Zupanc Avsic; T Avsic Zupanc; T Avsic; Tatjana Avsic; T Avšič Zupanc; T Avšič Zupanc; T. Avšič Županc; T. Avšič Županc" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="3277667" Afiliacija="" ArrsID="10331" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="41306" Ime="Miroslav" Priimek="Petrovec" AltIme="M. Petrovec; Mirč Petrovec; M Petrovec" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="4321379" Afiliacija="" ArrsID="15902" ORCID=""></Oseba>
  </Osebe>
  <Identifikatorji>
    <Identifikator ID="4" Sifra="UDK" Naziv="UDK" URL="">616.9</Identifikator>
    <Identifikator ID="9" Sifra="ISSN-clanka" Naziv="ISSN pri članku" URL="">0163-4453</Identifikator>
    <Identifikator ID="15" Sifra="DOI" Naziv="DOI" URL="http://dx.doi.org/10.1016/j.jinf.2026.106776">10.1016/j.jinf.2026.106776</Identifikator>
    <Identifikator ID="3" Sifra="CobissID" Naziv="COBISS_ID" URL="https://plus.cobiss.net/cobiss/si/sl/bib/280582403">280582403</Identifikator>
  </Identifikatorji>
  <Datoteke>
    <Datoteka ID="235062" DatotekaNRID="14703131" NamenDatotekeID="2" NamenDatoteke="Predstavitvena datoteka" FormatDatotekeID="2" FormatDatoteke=".pdf" MIME="application/pdf" IkonaFormata="pdf.png" IkonaFormataPolniUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/teme/rulDev/img/fileTypes/pdf.png" VelikostDatoteke="2677209" VelikostDatotekeKratko="2,55 MB" DatumVstavljanja="2026-06-07 07:44:39" JeZbrisana="false" JeJavnoVidna="true" JeIndeksirana="true" JeVidno="true" VidnoOd="01.01.1970" Zaporedje="0">
      <Naziv>RAZ_Korva_Misa_2026.pdf</Naziv>
      <OrgNaziv>RAZ_Korva_Misa_2026.pdf</OrgNaziv>
      <URL></URL>
      <Opis></Opis>
      <OpisTujJezik></OpisTujJezik>
      <UrlObdelave></UrlObdelave>
      <FrekvencaAzuriranjaID>1</FrekvencaAzuriranjaID>
      <Verzija></Verzija>
      <MD5>F2AEAB5B95B375117C32DA71FEA95D2C</MD5>
      <SHA256>8eb20af8b9f05d8ef4f56e517b87245576d65ec0b8ac0838d74a77aa33d14f68</SHA256>
      <UUID>98735e8e-6233-11f1-b0ab-0050569b8976</UUID>
      <PID></PID>
      <PrenosPolniUrl>https://repozitorij.uni-lj.si/Dokument.php?lang=slv&amp;id=235062</PrenosPolniUrl>
      <Vsebine>
        <Vsebina TipVsebine="GoloBesedilo" JezikID="1033" Oznaka="" Dolzina="44116"></Vsebina>
      </Vsebine>
    </Datoteka>
    <Datoteka ID="235061" DatotekaNRID="0" NamenDatotekeID="5" NamenDatoteke="Izvorni URL" FormatDatotekeID="56" FormatDatoteke="URL" MIME="text/url" IkonaFormata="url.png" IkonaFormataPolniUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/teme/rulDev/img/fileTypes/url.png" VelikostDatoteke="0" VelikostDatotekeKratko="0,00 KB" DatumVstavljanja="2026-06-07 07:36:27" JeZbrisana="false" JeJavnoVidna="true" JeIndeksirana="false" JeVidno="true" VidnoOd="01.01.1970" Zaporedje="1">
      <Naziv></Naziv>
      <OrgNaziv></OrgNaziv>
      <URL>https://www.journalofinfection.com/article/S0163-4453(26)00101-5/fulltext</URL>
      <Opis></Opis>
      <OpisTujJezik></OpisTujJezik>
      <UrlObdelave></UrlObdelave>
      <FrekvencaAzuriranjaID>1</FrekvencaAzuriranjaID>
      <Verzija></Verzija>
      <MD5></MD5>
      <SHA256></SHA256>
      <UUID>7338a774-6232-11f1-b0ab-0050569b8976</UUID>
      <PID></PID>
      <PrenosPolniUrl>https://repozitorij.uni-lj.si/Dokument.php?lang=slv&amp;id=235061</PrenosPolniUrl>
      <Vsebine>
      </Vsebine>
    </Datoteka>
  </Datoteke>
  <Organizacije>
    <Organizacija OrganizacijaID="18" Kratica="MF" ZavodEvsID="0000072" Logo="" LogoPolniUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/teme/rulDev/img/logo/">Medicinska fakulteta </Organizacija>
  </Organizacije>
  <OrganizacijeVira>
  </OrganizacijeVira>
  <MetodeZbiranjaPodatkov>
  </MetodeZbiranjaPodatkov>
  <TipologijaDela ID="1.01" Koda="1.01" Naziv="Izvirni znanstveni članek" SchemaOrg="Article"></TipologijaDela>
  <OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/ARIS//P3-0083-2022" Stevilka="P3-0083-2022" Naslov="Odnosi parazitskega obstajanja" Akronim="" Delez="0"></OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/ARIS//P3-0296-2022" Stevilka="P3-0296-2022" Naslov="Bolezni in povzročitelji, ki jih v Sloveniji prenašajo členonožci" Akronim="" Delez="0"></OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/Univerzitetni%20klini%C4%8Dni%20center%20Ljubljana//20230154" Stevilka="20230154" Naslov="Vzroki vročinskih bolezni po vbodu klopa" Akronim="" Delez="0"></OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/ARIS//MRIC-UL-IC-BSL3%2B" Stevilka="MRIC-UL-IC-BSL3+" Naslov="Mreža raziskovalnih infrastrukturnih centrov" Akronim="MRIC UL" Delez="0"></OpenAIRE>
  </OpenAIRE>
  <Ostalo>
    <StIrodsDatotek>0</StIrodsDatotek>
    <StDatotekPodTrajnimEmbargom>0</StDatotekPodTrajnimEmbargom>
    <StDatotekZOmejenimDostopom>0</StDatotekZOmejenimDostopom>
  </Ostalo>
</Gradivo>
