20.500.12556/RUL-181284 Analiza membransko aktivnih proteinov iz gliv za razvoj novih lipidnih označevalcev in biopesticidov raziskovalni podatki, obravnavani v doktorskem delu Analysis of membrane-active proteins from fungi for the development of new lipid markers and biopesticides research data underlying the doctoral dissertation V raziskavi smo biokemijsko opredelili egerolizine in njihove proteinske partnerje z domeno MACPF iz izbranih bazidiomicet, pri čemer je bil glavni poudarek na uporabljenih metodah. Najprej smo izvedli bioinformatsko analizo za določitev osnovnih biokemijskih lastnosti proteinov, nato pa pripravili rekombinantne proteine za eksperimentalno delo. Strukturne lastnosti smo preučevali s CD-spektrometrijo. Za opredelitev interakcij z membranami smo uporabili pripravo lipidnih mešanic, sedimentacijski test in površinsko plazmonsko resonanco (SPR). Funkcionalno aktivnost citolitičnih kompleksov smo analizirali s testom sproščanja kalceina, testom hemolize ter z določitvijo citotoksičnosti na celični liniji Sf9. Na koncu smo izvedli še teste toksičnosti na žuželkah. S temi metodami smo ovrednotili strukturne, vezavne in funkcionalne lastnosti preučevanih proteinov. In this study, we biochemically characterized egerolysins and their protein partners containing the MACPF domain from selected basidiomycetes, with a primary focus on the methods used. First, we performed a bioinformatic analysis to determine the basic biochemical properties of the proteins, followed by the preparation of recombinant proteins for experimental work. Structural properties were analyzed using CD spectroscopy. To investigate membrane interactions, we used lipid mixture preparation, sedimentation assays, and surface plasmon resonance (SPR). The functional activity of cytolytic complexes was assessed using a calcein release assay, a hemolysis assay, and cytotoxicity testing on the Sf9 cell line. Finally, toxicity assays were performed on insects. Using these methods, we evaluated the structural, binding, and functional properties of the studied proteins. egerolizini MACPF proteini membrane lipidi citolitični kompleksi aegerolysins MACPF proteins membranes lipids cytolytic complexes true false false Slovenski jezik Angleški jezik Slovenija Od/From 1. 10. 2021 do/till 30. 9. 2025 Neznano 2026-03-30 14:28:59 2026-04-07 21:23:58 2026-04-08 04:27:25 0000-00-00 00:00:00 2026 0 0 0000-00-00 NiDoloceno NiDoloceno NiDoloceno 0000-00-00 0000-00-00 0000-00-00 PREBERI_ME.txt PREBERI_ME.txt PREBERI ME 1 0B5F9DBF01E76FD58980C7F6463DD5D4 2f6581f900b61bb0862dc0675a2d3d8adf1153910fde266f5e77a6993d7aa0b5 009875fc-2c34-11f1-b0ab-0050569b8976 https://repozitorij.uni-lj.si/Dokument.php?lang=slv&id=231587 README.txt README.txt README 1 21A8F14AB180FE798956910B1AF436BA 13a90ceeec8237235c4e9531951e855691ba5d2725cfaed72ebf32c824bbf3b8 04a8f89f-2c34-11f1-b0ab-0050569b8976 https://repozitorij.uni-lj.si/Dokument.php?lang=slv&id=231588 Raziskovalni_podatki_doktorske_dizertacije.xlsx Raziskovalni_podatki_doktorske_dizertacije.xlsx Raziskovalni podatki doktorske dizertacije 1 7763CF0D06551810FFE1555AB37B8BC0 b5430d4f1743574924d159855d684fec8a21033ac9a22e4211909fe6317ed993 0e335a50-2c34-11f1-b0ab-0050569b8976 https://repozitorij.uni-lj.si/Dokument.php?lang=slv&id=231589 https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?id=177547&lang=slv Doktorsko delo 0 ecec7a16-2c33-11f1-b0ab-0050569b8976 https://repozitorij.uni-lj.si/Dokument.php?lang=slv&id=231586 Biotehniška fakulteta Poskus Poskus: Laboratorij Poskus: Teren/Intervencija Meritve in testi 0 0 0