20.500.12556/RUL-173485 Primerjava genomske asociacijske študije celega genoma (GWAS) in rekombinantnega mapiranja v raziskavah kompleksnih genetskih lastnosti rastlin Comparison of genome-wide association studies (GWAS) and recombinantmapping in the study of complex genetic traits in plants V diplomski nalogi primerjamo asociacijsko študijo celotnega genoma (GWAS) in rekombinantno mapiranje lokusov kvantitativnih lastnosti (QTL) pri rastlinah. Metodi se razlikujeta po tipu uporabljenih populacij, ločljivosti, statistični moči, občutljivosti na populacijsko strukturo ter času raziskave. GWAS uporablja naravne populacije ali diverzitetne panele s kratkim dosegom LD, kar omogoča visoko ločljivost in hkratno detekcijo več lokusov, vendar je občutljiv na populacijsko stratifikacijo in sorodnost, zato zahteva ustrezne statistične korekcije in ponovitve v različnih okoljih. Rekombinantno mapiranje temelji na dvostarševskih populacijah, pri katerih sta znana vrsta križanja in genotipa staršev, kar ima za posledico nižjo ločljivost in večjo statistično moč za detekcijo redkih alelov. Ponovljivost v različnih okoljih omogočajo trajne, pretežno homozigotne populacije, ločljivost pa se dodatno izboljša z večstarševskimi populacijami. Metodi sta med seboj komplementarni, saj GWAS omogoča hitro zaznavanje kandidatskih regij, rekombinantno mapiranje pa te detekcije potrdi in oceni učinke QTL na kompleksne lastnosti. Njuna skupna uporaba pospeši identifikacijo genov in njihovo uvajanje v žlahtniteljske programe. In this bachelor thesis, we compare genome-wide association studies (GWAS) and recombinant mapping of quantitative trait loci (QTL) in plants. The methods differ in the types of populations used, resolution, statistical power, sensitivity to population structure, and study duration. GWAS uses natural populations or diversity panels with short-range LD, enabling high resolution and the simultaneous detection of multiple loci, but it is sensitive to population stratification and relatedness, therefore, it requires appropriate statistical corrections and replication across different environments. Recombinant mapping is based on biparental populations in which the type of cross and the parental genotypes are known, resulting in lower resolution but greater statistical power to detect rare alleles. Replication across environments is facilitated by permanent, predominantly homozygous populations and resolution can be further improved with multi-parent populations. The methods are complementary, beacuse GWAS enables rapid identification of candidate regions, while recombinant mapping validates these detections and estimates the effects of QTL on complex traits. Their combined use accelerates gene identification and its incorporation into breeding programs. kompleksne lastnosti v rastlinah GWAS rekombinantno mapiranje markerji populacije complex traits in plants GWAS recombinant mapping marker populations true false false Slovenski jezik Angleški jezik Diplomsko delo/naloga 2025-09-18 07:16:37 2025-09-18 07:16:41 2025-11-09 04:04:10 0000-00-00 00:00:00 2025 0 0 0000-00-00 NiDoloceno NiDoloceno NiDoloceno 0000-00-00 0000-00-00 0000-00-00 264804 249516291 51417.pdf 51417.pdf 1 EBE38B392F66AD2F934D37B87E314EF7 6a85d0bf11c29af04b66f234e47f9db09da8438f520cc881ceef7ca2231eb621 7ce74a83-944e-11f0-9328-0050569b8976 https://repozitorij.uni-lj.si/Dokument.php?lang=slv&id=218000 Biotehniška fakulteta 0 0 0