<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<Gradivo ID="169968" NadgradivoID="5958" NRID="26675324" OceID="0" DomainUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/" IzpisPolniUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?lang=slv&amp;id=169968" StOgledov="556" StPrenosov="210" StOcen="0" VsotaOcen="0" DatumIzvoza="2026-06-27 17:41:15" OcenaSkupna="0" StPodgradiv="0" StudijskiProgramEvsID="" JeIndeksirano="0" JeVecAvtorjev="0" DovoliZahtevkeZaDostop="0">
  <PID Url="http://hdl.handle.net/20.500.12556/RUL-169968">20.500.12556/RUL-169968</PID>
  <Naslov>Identification of potential human targets for epigallocatechin gallate through a novel protein binding site screening approach</Naslov>
  <Podnaslov></Podnaslov>
  <TujJezik_Naslov></TujJezik_Naslov>
  <TujJezik_Podnaslov></TujJezik_Podnaslov>
  <Opis>Context Epigallocatechin-3-gallate (EGCG), a compound found in green tea, is known for its anticancer properties, although its specific protein targets remain largely undefined. In this study, we identified EGCG targets across the human proteome using a novel protein binding site screening approach. Among the 20 most likely predicted targets, six proteins—KRAS, FXa, MMP1, PLA2G2A, Hb, and CDK2—had been experimentally validated in previous studies. Fourteen additional proteins, including five kinases, were newly predicted as potential targets, all of which are implicated in cancer development and may mediate EGCG’s anticancer effects. Enrichment analysis revealed KEGG pathways associated with cancer, with KRAS and PIM1 appearing as key nodes. These findings, which align with previous experimental research, offer new insights into the molecular mechanisms of EGCG and its potential role in modulating cancer-related pathways.
Methods An approach was devised to screen EGCG with 36,532 human protein binding sites using the ProBiS-Dock algorithm and the ProBiS-Dock database. Network and enrichment analyses with Cytoscape and StringApp identified protein interactions and KEGG pathways, revealing potential anticancer mechanisms of EGCG.</Opis>
  <TujJezik_Opis></TujJezik_Opis>
  <KljucneBesede>
    <Beseda>epigallocatechin-3-gallate</Beseda>
    <Beseda>ProBiS-Dock algorithm</Beseda>
    <Beseda>ProBiS-Dock database</Beseda>
    <Beseda>inverse molecular docking</Beseda>
    <Beseda>target protein prediction</Beseda>
  </KljucneBesede>
  <TujJezik_KljucneBesede>
    <Beseda>biokemija</Beseda>
    <Beseda>rak</Beseda>
    <Beseda>epigalokatehin galat</Beseda>
  </TujJezik_KljucneBesede>
  <Potrjeno>true</Potrjeno>
  <JeZaklenjeno>false</JeZaklenjeno>
  <JeRecenzirano>true</JeRecenzirano>
  <Zaloznik></Zaloznik>
  <Izvor></Izvor>
  <Jezik ID="1033" ISO639-3="eng">Angleški jezik</Jezik>
  <TujJezik ID="1060" ISO639-3="slv">Slovenski jezik</TujJezik>
  <Povezave></Povezave>
  <Pokrivanje></Pokrivanje>
  <CasovnoPokritje></CasovnoPokritje>
  <AvtorskePravice></AvtorskePravice>
  <VrstaGradiva ID="dk_c" DRIVER="info:eu-repo/semantics/article">Članek v reviji</VrstaGradiva>
  <DatumVstavljanja>2025-06-27 14:00:16</DatumVstavljanja>
  <DatumObjave>2025-06-27 14:00:18</DatumObjave>
  <DatumSpremembe>2026-06-08 13:50:23</DatumSpremembe>
  <DatumTrajnegaHranjenja>0000-00-00 00:00:00</DatumTrajnegaHranjenja>
  <LetoIzida>2025</LetoIzida>
  <LetoIzidaDo>0</LetoIzidaDo>
  <KrajIzida></KrajIzida>
  <LetoIzvedbe>0</LetoIzvedbe>
  <KrajIzvedbe></KrajIzvedbe>
  <Opomba></Opomba>
  <StStrani>12 str.</StStrani>
  <StevilcenjeNivo1>iss. 7, art. 189</StevilcenjeNivo1>
  <StevilcenjeNivo2>Vol. 31</StevilcenjeNivo2>
  <Kronologija>2025</Kronologija>
  <Patent_Stevilka></Patent_Stevilka>
  <Patent_DatumVeljavnosti>0000-00-00</Patent_DatumVeljavnosti>
  <VerzijaDokumenta>Zaloznikova</VerzijaDokumenta>
  <StatusObjaveDrugje>Objavljeno</StatusObjaveDrugje>
  <VrstaStroskaObjave>NiDoloceno</VrstaStroskaObjave>
  <DatumPoslanoVRecenzijo>0000-00-00</DatumPoslanoVRecenzijo>
  <DatumSprejetjaClanka>0000-00-00</DatumSprejetjaClanka>
  <DatumObjaveClanka>0000-00-00</DatumObjaveClanka>
  <Licence>
    <Licenca ID="6" Kratica="CC BY 4.0" Naziv="Creative Commons Priznanje avtorstva 4.0 Mednarodna" URL="http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/deed.sl" Logo="by.png" LogoPolniUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/teme/rulDev/img/licence/by.png" DatumZacetkaLicenciranja="" VezanoNa="" VezanoNaAng="" Besedilo="" BesediloAng=""></Licenca>
  </Licence>
  <EmbargoDo></EmbargoDo>
  <VrstaEmbarga ID="1" Naziv="Takojšnja javna objava" OpenAIREDostop="openAccess"></VrstaEmbarga>
  <Osebe>
    <Oseba ID="146301" Ime="Jernej" Priimek="Hirci" AltIme="" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="444711427" Afiliacija="" ArrsID="" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="146302" Ime="Sandra" Priimek="Škufca" AltIme="" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="313798499" Afiliacija="" ArrsID="" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="605" Ime="Tanja" Priimek="Kunej" AltIme="T. Kunej; T Kunej" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="4416867" Afiliacija="" ArrsID="16361" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="23611" Ime="Dušanka" Priimek="Janežič" AltIme="D. Janežič; Dušanka Janežic; Dusanka Janezic; D. Janezic" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="2672483" Afiliacija="" ArrsID="06734" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="24522" Ime="Janez" Priimek="Konc" AltIme="J. Konc" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="44798051" Afiliacija="" ArrsID="25435" ORCID=""></Oseba>
  </Osebe>
  <Identifikatorji>
    <Identifikator ID="4" Sifra="UDK" Naziv="UDK" URL="">577</Identifikator>
    <Identifikator ID="9" Sifra="ISSN-clanka" Naziv="ISSN pri članku" URL="">0948-5023</Identifikator>
    <Identifikator ID="15" Sifra="DOI" Naziv="DOI" URL="http://dx.doi.org/10.1007/s00894-025-06410-y">10.1007/s00894-025-06410-y</Identifikator>
    <Identifikator ID="3" Sifra="CobissID" Naziv="COBISS_ID" URL="https://plus.cobiss.net/cobiss/si/sl/bib/239493635">239493635</Identifikator>
  </Identifikatorji>
  <Datoteke>
    <Datoteka ID="211839" DatotekaNRID="14361553" NamenDatotekeID="2" NamenDatoteke="Predstavitvena datoteka" FormatDatotekeID="2" FormatDatoteke=".pdf" MIME="application/pdf" IkonaFormata="pdf.png" IkonaFormataPolniUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/teme/rulDev/img/fileTypes/pdf.png" VelikostDatoteke="1827151" VelikostDatotekeKratko="1,74 MB" DatumVstavljanja="2025-06-27 14:12:03" JeZbrisana="false" JeJavnoVidna="true" JeIndeksirana="true" JeVidno="true" VidnoOd="01.01.1970" Zaporedje="0">
      <Naziv>RAZ_Hirci_Jernej_2025.pdf</Naziv>
      <OrgNaziv>RAZ_Hirci_Jernej_2025.pdf</OrgNaziv>
      <URL></URL>
      <Opis></Opis>
      <OpisTujJezik></OpisTujJezik>
      <UrlObdelave></UrlObdelave>
      <FrekvencaAzuriranjaID>1</FrekvencaAzuriranjaID>
      <Verzija></Verzija>
      <MD5>48766354F8BC168677CA21F7F0FA0444</MD5>
      <SHA256>32127a14494687677682d8d3e8d160b6bb089c7dc685d423c64e10dbb2f37fca</SHA256>
      <UUID>0e916573-534e-11f0-b232-0050569b8976</UUID>
      <PID></PID>
      <PrenosPolniUrl>https://repozitorij.uni-lj.si/Dokument.php?lang=slv&amp;id=211839</PrenosPolniUrl>
      <Vsebine>
        <Vsebina TipVsebine="GoloBesedilo" JezikID="1033" Oznaka="" Dolzina="45307"></Vsebina>
      </Vsebine>
    </Datoteka>
    <Datoteka ID="211838" DatotekaNRID="0" NamenDatotekeID="5" NamenDatoteke="Izvorni URL" FormatDatotekeID="56" FormatDatoteke="URL" MIME="text/url" IkonaFormata="url.png" IkonaFormataPolniUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/teme/rulDev/img/fileTypes/url.png" VelikostDatoteke="0" VelikostDatotekeKratko="0,00 KB" DatumVstavljanja="2025-06-27 14:00:21" JeZbrisana="false" JeJavnoVidna="true" JeIndeksirana="false" JeVidno="true" VidnoOd="01.01.1970" Zaporedje="1">
      <Naziv></Naziv>
      <OrgNaziv></OrgNaziv>
      <URL>https://link.springer.com/article/10.1007/s00894-025-06410-y</URL>
      <Opis></Opis>
      <OpisTujJezik></OpisTujJezik>
      <UrlObdelave></UrlObdelave>
      <FrekvencaAzuriranjaID>1</FrekvencaAzuriranjaID>
      <Verzija></Verzija>
      <MD5></MD5>
      <SHA256></SHA256>
      <UUID>6c280440-534c-11f0-b232-0050569b8976</UUID>
      <PID></PID>
      <PrenosPolniUrl>https://repozitorij.uni-lj.si/Dokument.php?lang=slv&amp;id=211838</PrenosPolniUrl>
      <Vsebine>
      </Vsebine>
    </Datoteka>
  </Datoteke>
  <Organizacije>
    <Organizacija OrganizacijaID="5" Kratica="BF" ZavodEvsID="0000057" Logo="" LogoPolniUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/teme/rulDev/img/logo/">Biotehniška fakulteta </Organizacija>
    <Organizacija OrganizacijaID="8" Kratica="FFA" ZavodEvsID="0000061" Logo="" LogoPolniUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/teme/rulDev/img/logo/">Fakulteta za farmacijo </Organizacija>
  </Organizacije>
  <OrganizacijeVira>
  </OrganizacijeVira>
  <MetodeZbiranjaPodatkov>
  </MetodeZbiranjaPodatkov>
  <TipologijaDela ID="1.01" Koda="1.01" Naziv="Izvirni znanstveni članek" SchemaOrg="Article"></TipologijaDela>
  <OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/ARIS//P4-0220" Stevilka="P4-0220" Naslov="Primerjalna genomika in genomska biodiverziteta" Akronim="" Delez="0"></OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/ARIS//N1-0142" Stevilka="N1-0142" Naslov="COGEVAB: nova računalniška orodja na molekularni skali za študij vpliva genskih variacij na vezavo zdravil" Akronim="" Delez="0"></OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/ARIS//N1-0209" Stevilka="N1-0209" Naslov="Orodja za inovativno oblikovanje zdravil" Akronim="" Delez="0"></OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/ARIS//J1-4414" Stevilka="J1-4414" Naslov="ProBiS-Fold pristop za določanje vezavnih mest za celoten strukturni človeški proteom pri odkrivanju zdravil" Akronim="" Delez="0"></OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/ARIS//L7-8269" Stevilka="L7-8269" Naslov="Novi pristopi za boljša biološka zdravila" Akronim="" Delez="0"></OpenAIRE>
  </OpenAIRE>
  <Ostalo>
    <StIrodsDatotek>0</StIrodsDatotek>
    <StDatotekPodTrajnimEmbargom>0</StDatotekPodTrajnimEmbargom>
    <StDatotekZOmejenimDostopom>0</StDatotekZOmejenimDostopom>
  </Ostalo>
</Gradivo>
