<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<Gradivo ID="164775" NadgradivoID="5414" NRID="25391012" OceID="0" DomainUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/" IzpisPolniUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?lang=slv&amp;id=164775" StOgledov="925" StPrenosov="398" StOcen="0" VsotaOcen="0" DatumIzvoza="2026-06-18 19:18:26" OcenaSkupna="0" StPodgradiv="0" StudijskiProgramEvsID="" JeIndeksirano="0" JeVecAvtorjev="0" DovoliZahtevkeZaDostop="0">
  <PID Url="http://hdl.handle.net/20.500.12556/RUL-164775">20.500.12556/RUL-164775</PID>
  <Naslov>Designed allosteric protein logic</Naslov>
  <Podnaslov></Podnaslov>
  <TujJezik_Naslov></TujJezik_Naslov>
  <TujJezik_Podnaslov></TujJezik_Podnaslov>
  <Opis>The regulation of protein function by external or internal signals is one of the key features of living organisms. The ability to directly control the function of a selected protein would represent a valuable tool for regulating biological processes. Here, we present a generally applicable regulation of proteins called INSRTR, based on inserting a peptide into a loop of a target protein that retains its function. We demonstrate the versatility and robustness of coiled-coil-mediated regulation, which enables designs for either inactivation or activation of selected protein functions, and implementation of two-input logic functions with rapid response in mammalian cells. The selection of insertion positions in tested proteins was facilitated by using a predictive machine learning model. We showcase the robustness of the INSRTR strategy on proteins with diverse folds and biological functions, including enzymes, signaling mediators, DNA binders, transcriptional regulators, reporters, and antibody domains implemented as chimeric antigen receptors in T cells. Our findings highlight the potential of INSRTR as a powerful tool for precise control of protein function, advancing our understanding of biological processes and developing biotechnological and therapeutic interventions.</Opis>
  <TujJezik_Opis></TujJezik_Opis>
  <KljucneBesede>
    <Beseda>cell signalling</Beseda>
    <Beseda>protein folding</Beseda>
  </KljucneBesede>
  <TujJezik_KljucneBesede>
    <Beseda>biokemija</Beseda>
    <Beseda>beljakovine</Beseda>
    <Beseda>proteini</Beseda>
    <Beseda>DNK</Beseda>
    <Beseda>receptorji</Beseda>
    <Beseda>protitelesa</Beseda>
  </TujJezik_KljucneBesede>
  <Potrjeno>true</Potrjeno>
  <JeZaklenjeno>false</JeZaklenjeno>
  <JeRecenzirano>true</JeRecenzirano>
  <Zaloznik></Zaloznik>
  <Izvor></Izvor>
  <Jezik ID="1033" ISO639-3="eng">Angleški jezik</Jezik>
  <TujJezik ID="1060" ISO639-3="slv">Slovenski jezik</TujJezik>
  <Povezave></Povezave>
  <Pokrivanje></Pokrivanje>
  <CasovnoPokritje></CasovnoPokritje>
  <AvtorskePravice></AvtorskePravice>
  <VrstaGradiva ID="dk_c" DRIVER="info:eu-repo/semantics/article">Članek v reviji</VrstaGradiva>
  <DatumVstavljanja>2024-11-11 14:44:57</DatumVstavljanja>
  <DatumObjave>2024-11-11 14:44:57</DatumObjave>
  <DatumSpremembe>2024-11-22 14:56:05</DatumSpremembe>
  <DatumTrajnegaHranjenja>0000-00-00 00:00:00</DatumTrajnegaHranjenja>
  <LetoIzida>2024</LetoIzida>
  <LetoIzidaDo>0</LetoIzidaDo>
  <KrajIzida></KrajIzida>
  <LetoIzvedbe>0</LetoIzvedbe>
  <KrajIzvedbe></KrajIzvedbe>
  <Opomba></Opomba>
  <StStrani>15 str.</StStrani>
  <StevilcenjeNivo1>art. 8</StevilcenjeNivo1>
  <StevilcenjeNivo2>Vol. 10</StevilcenjeNivo2>
  <Kronologija>2024</Kronologija>
  <Patent_Stevilka></Patent_Stevilka>
  <Patent_DatumVeljavnosti>0000-00-00</Patent_DatumVeljavnosti>
  <VerzijaDokumenta>Zaloznikova</VerzijaDokumenta>
  <StatusObjaveDrugje>Objavljeno</StatusObjaveDrugje>
  <VrstaStroskaObjave>NiDoloceno</VrstaStroskaObjave>
  <DatumPoslanoVRecenzijo>0000-00-00</DatumPoslanoVRecenzijo>
  <DatumSprejetjaClanka>0000-00-00</DatumSprejetjaClanka>
  <DatumObjaveClanka>0000-00-00</DatumObjaveClanka>
  <Licence>
    <Licenca ID="6" Kratica="CC BY 4.0" Naziv="Creative Commons Priznanje avtorstva 4.0 Mednarodna" URL="http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/deed.sl" Logo="by.png" LogoPolniUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/teme/rulDev/img/licence/by.png" DatumZacetkaLicenciranja="" VezanoNa="" VezanoNaAng="" Besedilo="" BesediloAng=""></Licenca>
  </Licence>
  <EmbargoDo></EmbargoDo>
  <VrstaEmbarga ID="1" Naziv="Takojšnja javna objava" OpenAIREDostop="openAccess"></VrstaEmbarga>
  <Osebe>
    <Oseba ID="100958" Ime="Tjaša" Priimek="Plaper" AltIme="T. Plaper" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="267054691" Afiliacija="" ArrsID="39111" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="133153" Ime="Estera" Priimek="Merljak" AltIme="Estera Meljak" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="258148195" Afiliacija="" ArrsID="50615" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="140981" Ime="Tina" Priimek="Fink" AltIme="" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="201099875" Afiliacija="" ArrsID="35277" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="130335" Ime="Tadej" Priimek="Satler" AltIme="" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="183719267" Afiliacija="" ArrsID="54582" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="140971" Ime="Ajasja" Priimek="Ljubetič" AltIme="A. Ljubetič; Ajasja Ljubetic" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="157110115" Afiliacija="" ArrsID="31709" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="72827" Ime="Duško" Priimek="Lainšček" AltIme="Dusko Lainscek; Duško Lainšcek; D. Lainšček; D. Lainscek" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="191293795" Afiliacija="" ArrsID="34069" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="118215" Ime="Vid" Priimek="Jazbec" AltIme="V. Jazbec" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="267477091" Afiliacija="" ArrsID="52001" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="30735" Ime="Mojca" Priimek="Benčina" AltIme="M. Bencina; Mojca Bencina; M. Benčina; Mojca Benina; M Benčina" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="4017763" Afiliacija="" ArrsID="14360" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="140982" Ime="Sintija" Priimek="Stevanoska" AltIme="" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="416625923" Afiliacija="" ArrsID="57192" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="100" Ime="Sašo" Priimek="Džeroski" AltIme="S. Dzeroski; Saso Dzeroski;  Dzeroski; Saša Džeroski; S. Džeroski; Sašo Đeroski" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="3431779" Afiliacija="" ArrsID="11130" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="1154" Ime="Roman" Priimek="Jerala" AltIme="Roman Jeral; R. Jerala" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="2651747" Afiliacija="" ArrsID="06628" ORCID=""></Oseba>
  </Osebe>
  <Identifikatorji>
    <Identifikator ID="4" Sifra="UDK" Naziv="UDK" URL="">577</Identifikator>
    <Identifikator ID="9" Sifra="ISSN-clanka" Naziv="ISSN pri članku" URL="">2056-5968</Identifikator>
    <Identifikator ID="15" Sifra="DOI" Naziv="DOI" URL="http://dx.doi.org/10.1038/s41421-023-00635-y">10.1038/s41421-023-00635-y</Identifikator>
    <Identifikator ID="3" Sifra="CobissID" Naziv="COBISS_ID" URL="https://plus.cobiss.net/cobiss/si/sl/bib/183898371">183898371</Identifikator>
  </Identifikatorji>
  <Datoteke>
    <Datoteka ID="195449" DatotekaNRID="13991982" NamenDatotekeID="2" NamenDatoteke="Predstavitvena datoteka" FormatDatotekeID="2" FormatDatoteke=".pdf" MIME="application/pdf" IkonaFormata="pdf.png" IkonaFormataPolniUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/teme/rulDev/img/fileTypes/pdf.png" VelikostDatoteke="2167702" VelikostDatotekeKratko="2,07 MB" DatumVstavljanja="2024-11-11 14:46:28" JeZbrisana="false" JeJavnoVidna="true" JeIndeksirana="true" JeVidno="true" VidnoOd="01.01.1970" Zaporedje="0">
      <Naziv>s41421-023-00635-y_(1).pdf</Naziv>
      <OrgNaziv>s41421-023-00635-y_(1).pdf</OrgNaziv>
      <URL></URL>
      <Opis></Opis>
      <OpisTujJezik></OpisTujJezik>
      <UrlObdelave></UrlObdelave>
      <FrekvencaAzuriranjaID>1</FrekvencaAzuriranjaID>
      <Verzija></Verzija>
      <MD5>6E2EA33A3363AE51623FDF5EA116200E</MD5>
      <SHA256>924dd28daa197f853da2d28f4b6b5451b43374eb7b303914d6cba11c4112354c</SHA256>
      <UUID>fd4536b7-a032-11ef-b232-0050569b8976</UUID>
      <PID></PID>
      <PrenosPolniUrl>https://repozitorij.uni-lj.si/Dokument.php?lang=slv&amp;id=195449</PrenosPolniUrl>
      <Vsebine>
        <Vsebina TipVsebine="GoloBesedilo" JezikID="1033" Oznaka="" Dolzina="65696"></Vsebina>
      </Vsebine>
    </Datoteka>
    <Datoteka ID="195448" DatotekaNRID="0" NamenDatotekeID="5" NamenDatoteke="Izvorni URL" FormatDatotekeID="56" FormatDatoteke="URL" MIME="text/url" IkonaFormata="url.png" IkonaFormataPolniUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/teme/rulDev/img/fileTypes/url.png" VelikostDatoteke="0" VelikostDatotekeKratko="0,00 KB" DatumVstavljanja="2024-11-11 14:45:00" JeZbrisana="false" JeJavnoVidna="true" JeIndeksirana="false" JeVidno="true" VidnoOd="01.01.1970" Zaporedje="1">
      <Naziv></Naziv>
      <OrgNaziv></OrgNaziv>
      <URL>https://www.nature.com/articles/s41421-023-00635-y</URL>
      <Opis></Opis>
      <OpisTujJezik></OpisTujJezik>
      <UrlObdelave></UrlObdelave>
      <FrekvencaAzuriranjaID>1</FrekvencaAzuriranjaID>
      <Verzija></Verzija>
      <MD5></MD5>
      <SHA256></SHA256>
      <UUID>c8bd7425-a032-11ef-b232-0050569b8976</UUID>
      <PID></PID>
      <PrenosPolniUrl>https://repozitorij.uni-lj.si/Dokument.php?lang=slv&amp;id=195448</PrenosPolniUrl>
      <Vsebine>
      </Vsebine>
    </Datoteka>
  </Datoteke>
  <Organizacije>
    <Organizacija OrganizacijaID="18" Kratica="MF" ZavodEvsID="0000072" Logo="" LogoPolniUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/teme/rulDev/img/logo/">Medicinska fakulteta </Organizacija>
  </Organizacije>
  <OrganizacijeVira>
  </OrganizacijeVira>
  <MetodeZbiranjaPodatkov>
  </MetodeZbiranjaPodatkov>
  <TipologijaDela ID="1.01" Koda="1.01" Naziv="Izvirni znanstveni članek" SchemaOrg="Article"></TipologijaDela>
  <OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/ARRS//P4-0176" Stevilka="P4-0176" Naslov="Sintezna biologija in imunologija" Akronim="" Delez="0"></OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/ARRS//J1-9173" Stevilka="J1-9173" Naslov="Načrtovanje hitroodzivne signalne in logične poti na osnovi ortogonalnih proteaz" Akronim="" Delez="0"></OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/ARRS//Z4-2657" Stevilka="Z4-2657" Naslov="Načrtovanje fosforilacijske signalne poti v sesalskih celicah" Akronim="" Delez="0"></OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/ARRS//N4-0080" Stevilka="N4-0080" Naslov="Optimizacija sinteznobioloških genskih vezij in reprogramiranja celic s pomočjo mikrofluidike" Akronim="" Delez="0"></OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/ARRS//J1-4406" Stevilka="J1-4406" Naslov="CC-Trigger: izpodrivanje proteinskih obvitih vijačnic s pomočjo oprimkov omogoča kinetični nadzor proteinskih sestavov in napredne naprave z več stanji" Akronim="" Delez="0"></OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/EC/H2020/787115" Stevilka="787115" Naslov="Molecular machines based on coiled-coil protein origami" Akronim="MaCChines" Delez="0"></OpenAIRE>
  </OpenAIRE>
  <Ostalo>
    <StIrodsDatotek>0</StIrodsDatotek>
    <StDatotekPodTrajnimEmbargom>0</StDatotekPodTrajnimEmbargom>
    <StDatotekZOmejenimDostopom>0</StDatotekZOmejenimDostopom>
  </Ostalo>
</Gradivo>
