20.500.12556/RUL-160168 Primerjava tkivnospecifičnega promotorja kapa kazeina pri sesalcih Comparison of kappa casein tissue-specific promoter in mammals Tkivnospecifični geni se izražajo le v določenih tkivih; v drugih tkivih se izražajo v manjšem obsegu ali se ne izražajo. Regulatorne regije DNA, od katerih je odvisno izražanje genov, vplivajo na intenziteto transkripcije in so sestavljene iz promotorjev, ojačevalcev, utiševalcev in izolatorjev. Primer tkivnospecifičnega izražanja opazimo pri mlečni žlezi, ki izraža mlečne proteine. Ti se delijo na kazeine in sirotkine proteine. Uravnavanje izražanja mlečnih proteinov je zelo pomembno, saj se izražajo le med laktacijo in je odvisno od laktogenih hormonov. Sekvencirali smo promotorsko zaporedje κ-kazeina štirih osebkov dvoprstih lenivcev (Choloepus didactylus) in analizirali njihove poravnave. Rezultati poravnave promotorja κ-kazeina pri osebkih iste vrste (Choloepus didactylus) so po pričakovanjih pokazali visoko stopnjo ohranjenosti zaporedja in malo polimorfnih regij. Izvedli smo tudi analizo promotorskih zaporedij gena za κ-kazein različnih vrst sesalcev, z namenom medvrstne primerjave. Opazili smo zelo veliko podobnost med vrstami, kar nakazuje na dobro ohranjene sekvenčne motive. Na določenih delih pa se zaporedja razlikujejo, pri čemer prevladujejo insercije/delecije. Analizo smo razširili s primerjavo vezavnih mest za transkripcijske faktorje, kjer medvrstne razlike kažejo, da variabilnost promotorjev omogoča tkivnospecifično izražanje. Regulatory regions of DNA, which control gene expression, influence the intensity of the transcription and are composed of promoters, enhancers, silencers and insulators. An example of tissue-specific gene expression can be observed in the mammary gland, which expresses milk proteins that are divided into caseins and whey proteins. Regulation of milk protein gene expression is very important, since they are only expressed during lactation and are depended on lactogenic hormones. We sequenced the κ-casein promoter region of four Linnaeus's two-toed sloths (Choloepus didactylus) individuals and conducted an alignment analysis. The alignment results showed, as anticipated, a considerable degree of sequence conservation within the same species, while exhibiting minimal polymorphic regions. We performed a comparative analysis of κ-casein promoter region sequences across different mammalian species with the intention of interspecies comparison. This analysis revealed a remarkable degree of similarity, suggesting the presence of highly conserved sequence motifs. However, certain regions showed variations, mainly insertions/deletions. We further extended the analysis to compare transcription factor binding sites, revealing that interspecies differences indicate that considerable variability in promoter structures allow tissue-specific expression. kapa kazein tkivnospecifični promotor lenivec kappa casein tissue-specific promoter sloth true false false Slovenski jezik Angleški jezik Diplomsko delo/naloga 2024-08-22 11:10:00 2024-08-22 11:10:05 2024-08-29 12:39:00 0000-00-00 00:00:00 2024 0 0 0000-00-00 NiDoloceno NiDoloceno NiDoloceno 0000-00-00 0000-00-00 0000-00-00 22769 205756675 Mencigar_Masa_-_Primerjava_tkivnospecificnega_promotorja_kapa_kazeina_pri_sesalcih.pdf Mencigar_Masa_-_Primerjava_tkivnospecificnega_promotorja_kapa_kazeina_pri_sesalcih.pdf 1 E8D710B2394CF38ED1A851F77DA49024 2b04dad0511d773e2c568b3cc7d3ab07f2ad5b5e057c8763cf7bc3904853af39 1cb2da7c-6066-11ef-8f74-0050569b8976 https://repozitorij.uni-lj.si/Dokument.php?lang=slv&id=188670 Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo 0 0 0