20.500.12556/RUL-138071 Genotipizacija sevov respiratornega sincicijskega virusa (HRSV) pri otrocih, zdravljenih v intenzivni enoti Genotyping of respiratory syncytial virus (HRSV) among children, hospitalized in pediatric intensive care units Človeški respiratorni sincicijski virus (HRSV) je najpomembnejši virus, ki povzroča okužbe dihal pri dojenčkih in majhnih otrocih. Povzroča bronhiolitis in pljučnice. Virus obstaja v dveh antigenskih podskupinah označenih kot HRSV-A in HRSV-B ter številnih genotipih, katerih okužbe povzročajo različen potek bolezni. Ugotoviti smo želeli ali je zdravljenje v intenzivni enoti bolj povezano z okužbo s podskupino HRSV-A in nadalje ali določeni genotipi podskupine HRSV-A povzročajo posebej hudo klinično sliko, ki zahteva zdravljenje na oddelkih intenzivne terapije. V raziskavo smo vključili brise nosnega dela žrela otrok iz Pediatrične klinike Univerzitetnega kliničnega centra v Ljubljani. Izvedli smo vgnezdeni PCR. Pomnoževanje RNA smo izvedli na delu gena za hipervariabilno regijo beljakovine G. Pridelkom smo določili nukleotidno zaporedje z avtomatsko metodo sekvenciranja po Sangerju. Večina s HRSV okuženih otrok, vključenih v našo raziskavo, je spadala v starostno skupino 0-3 meseci. S HRSV je bilo okuženih več dečkov kot deklic. Med leti 2018 in 2021 smo v naši raziskavi dokazali 2 genotipa: HRSV-A/ON1 in HRSV-B/BA. Več otrok je bilo hospitaliziranih zaradi okužbe z genotipom HRSV-B/BA kot z genotipom HRSV-A/ON1. Razlike v pojavnosti genotipov glede na potek bolezni nismo ugotovili. Pred pojavom novega človeškega koronavirusa SARS-CoV-2 so prevladovale okužbe s podskupino HRSV-B, po pojavu SARS-CoV-2 pa okužbe s podskupino HRSV-A. Pojav novega človeškega koronavirusa SARS-CoV-2 je spremenil dinamiko okužb s HRSV. Sočasne okužbe so se pogosteje pojavljale pri otrocih hospitaliziranih v intenzivnem oddelku. Human respiratory syncytial virus (HRSV) is the major cause of respiratory infections in infants and young children. It causes bronchiolitis and pneumonia. There are two major HRSV subtypes, HRSV-A and HRSV-B and multiple genotypes which can result in different disease severity. We wanted to determine whether intensive care treatment is more associated with HRSV-A subgroup infection and further whether certain genotypes of the HRSV-A subgroup cause a particularly severe clinical picture that requires treatment in intensive care units. The study included nasopharyngeal swabs of children hospitalized at the University Children's Hospital in Ljubljana. Nested PCR and sequencing were preformed on hypervariable region of the G gene. Most of the children included in our study were 0-3 months old. HRSV was more often detected in boys. Between 2018 and 2021, two genotypes appeared in hospitalized children in our study: HRSV-A/ON1 and HRSV-B/BA. Genotype HRSV-B/BA was more often detected in hospitalized children than genotype HRSV-A/ON1. Both genotypes cause an equally severe course of the disease. Before the appearance of the new human coronavirus SARS-CoV-2, infections with the subgroup HRSV-B predominated and after the appearance of SARS-CoV-2, infections with the subgroup HRSV-A prevailed. The emergence of the new human coronavirus SARS-CoV-2 has changed the dynamics of HRSV infections. Coinfections with other respiratory viruses were more common in children hospitalized in the intensive care unit. virusi respiratorni sincicijski virus otroci bronhiolitis genotipizacija vgnezditveni RT-PCR v realnem času sekvenciranje viruses respiratory syncytial virus children bronchiolitis genotyping nested PCR sequencing true false false [M. Luštrek] Slovenski jezik Angleški jezik Magistrsko delo/naloga 2022-07-09 07:15:06 2022-07-09 07:15:58 2022-09-15 04:16:14 0000-00-00 00:00:00 2022 0 Ljubljana 0 0000-00-00 NiDoloceno NiDoloceno NiDoloceno 0000-00-00 0000-00-00 0000-00-00 578.5:616.9-053.2 204696 113108483 23234.pdf 23234.pdf 1 81969725252367C2DC6CC25E3EB0C1E2 f75877be05604936b7733b60d5730ebd3bc700085f201645b40554f679e6191f 010c4cd4-ff46-11ec-8aca-00155dcfd717 https://repozitorij.uni-lj.si/Dokument.php?lang=slv&id=158274 Biotehniška fakulteta 0 0 0