20.500.12556/RUL-131090 Razvoj spletne aplikacije za analizo PCR podatkov Development of web application for PCR data analysis Moderne metode za analizo bioloških podatkov so pogosto na voljo izključno v obliki programskih knjižnic. To pomeni, da je njihova uporaba omejena na strokovnjake z znanjem programiranja. Tovrstne metode strokovnjaki in znanstveniki s področja ved o življenju brez znanja programiranja torej težko uporabljajo pri svojem vsakdanjem delu. V tem delu sem se lotil izdelave spletne aplikacije za analizo PCR (angl. Polymerase Chain Reaction), konkretneje ddPCR (angl. digital-droplet Polymerase Chain Reaction) podatkov. Spletna aplikacija v zaledju uporablja knjižnico z implementacijo različnih sodobnih metod za analizo teh podatkov. Preko uporabniku prijaznega grafičnega vmesnika omogoča izvedbo izbranih analiz, prikaz rezultatov v tabelarični in grafični obliki ter njihov izvoz v poenotenem formatu. V delu predstavimo osnove različnih tipov analiz PCR in pripadajočih podatkov ter opišemo knjižnice, ki sem jih pri razvoju rešitve uporabil. Predstavimo funkcionalnosti in primere uporabe razvite aplikacije. Modern methods aimed to biological data analysis are commonly available exclusively in the form of programming libraries. This means that their use is limited to experts with programming knowledge. Therefore, such methods are difficult to be used by life-science experts and scientists in their everyday work. In this thesis we present the development of a web application for the analysis of PCR (Polymerase Chain Reaction) data -- ddPCR (digital-droplet Polymerase Chain Reaction) data, to be exact. The web application backend uses a library with different modern analysis methods of said data. With the use of a user-friendly graphical interface, it enables the user to perform selected analyses, display of results in a tabular and graphical formats, and export in a common report formats. We present the fundamentals of different types of PCR analyses their corresponding data and we describe the libraries, used in the proposed implementation. We present the functionalities of our application and illustrate its practical use on simple yet illustrative examples. PCR dPCR ddPCR analiza podatkov spletna aplikacija PCR dPCR ddPCR data analysis web application true false false Slovenski jezik Angleški jezik Diplomsko delo/naloga 2021-09-22 14:00:00 2021-09-22 14:00:03 2022-09-10 04:09:53 0000-00-00 00:00:00 2021 0 0 0000-00-00 NiDoloceno NiDoloceno NiDoloceno 0000-00-00 0000-00-00 0000-00-00 32454 78909699 Merhar_Aleksander_-_Razvoj_spletne_aplikacije_za_analizo_PCR_podatkov.pdf Merhar_Aleksander_-_Razvoj_spletne_aplikacije_za_analizo_PCR_podatkov.pdf 1 7157C05B39C8684144047E8BC0D77EA0 b7ae860aeddc11878c388a68a480db47d1c434c48ecb301d589179110aad345a 59ade160-1b9c-11ec-a523-00155dcfd717 https://repozitorij.uni-lj.si/Dokument.php?lang=slv&id=148338 Fakulteta za računalništvo in informatiko 0 0 0