20.500.12556/RUL-129972 Računske metode za odkrivanje napovednih markerskih genov v analizi preživetja Computational methods for the discovery of prognostic marker genes in survival analysis Prepoznavanje bioloških markerjev ni pomembno zgolj iz vidika njihove uporabe pri kliničnem odločanju ampak tudi zato, ker lahko z njimi dobimo nove vpoglede v samo delovanje mehanizma bolezni in o molekularnih procesih, ki jih povzročajo. V delu smo preučili izbrane metode, ki se uporabljajo pri analizi preživetvenih podatkov in prepoznavanju ter vrednotenju markerskih genov preživetja. Na področju analize preživetja smo opazili pomanjkanje enostavnih zbirk orodij z intuitivnim uporabniškim vmesnikom, ki bi z interaktivno analizo preživetvenih podatkov pomagala pri tovrstnih raziskavah. Intuitivna orodja s prilagodljivimi vmesniki in interaktivnimi vizualizacijami lahko bistveno pripomorejo k pospešitvi razvoja in vrednotenja potencialnih markerskih genov. Predlagane pristope smo zato vpeljali v okolje za podatkovno analitiko Orange ter izdelane gradnike preiskusili z uporabo na kliničnih podatkih o genskih izrazih. The identification of biological markers is essential because of their meaningful role in clinical decision-making. With data mining that leads to biomarker discovery, we may also gain novel insights into the disease mechanism and the molecular processes. We observed a lack of intuitive toolkits with exploratory user interfaces to help domain experts in biomarker discovery and analysis of the results. Intuitive tools with customizable user interfaces and interactive visualizations can significantly accelerate the development and evaluation of potential marker genes. The thesis focuses on survival analysis and examines and constructs methods and software implementations in the Orange data mining toolkit to identify potential survival marker genes. analiza preživetja markerski geni izražanje genov odkrivanje znanj iz podatkov interaktivna podatkovna analitika survival analysis marker genes gene expression data mining interactive data analysis true false false Slovenski jezik Angleški jezik Magistrsko delo/naloga 2021-09-09 15:10:00 2021-09-09 15:10:02 2022-09-09 04:14:10 0000-00-00 00:00:00 2021 0 0 0000-00-00 NiDoloceno NiDoloceno NiDoloceno 0000-00-00 0000-00-00 0000-00-00 28661 76890627 Kokosar_Jaka_-_Racunske_metode_za_odkrivanje_napovednih_markerskih_genov_v_analizi_prezivetja.pdf Kokosar_Jaka_-_Racunske_metode_za_odkrivanje_napovednih_markerskih_genov_v_analizi_prezivetja.pdf 1 FCF34F0FC2EF35A47F4EC3729ED6D922 93b2a80b56ce898e7fb9e0f90deec8f1c23d4a6bd8b76d1aba3263aca746bd9c ffd9e91f-116e-11ec-a523-00155dcfd717 https://repozitorij.uni-lj.si/Dokument.php?lang=slv&id=147022 Fakulteta za računalništvo in informatiko 0 0 0