<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<Gradivo ID="128738" NadgradivoID="145" NRID="13177521" OceID="0" DomainUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/" IzpisPolniUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?lang=slv&amp;id=128738" StOgledov="1969" StPrenosov="425" StOcen="0" VsotaOcen="0" DatumIzvoza="2026-09-09 13:49:48" OcenaSkupna="0" StPodgradiv="0" StudijskiProgramEvsID="" JeIndeksirano="0" JeVecAvtorjev="0" DovoliZahtevkeZaDostop="0">
  <PID Url="http://hdl.handle.net/20.500.12556/RUL-128738">20.500.12556/RUL-128738</PID>
  <Naslov>Viral protein Nef is detected in plasma of half of HIV-infected adults with undetectable plasma HIV RNA</Naslov>
  <Podnaslov></Podnaslov>
  <TujJezik_Naslov></TujJezik_Naslov>
  <TujJezik_Podnaslov></TujJezik_Podnaslov>
  <Opis>Objective
To address the role of translationally active HIV reservoir in chronic inflammation and non-AIDS related disorders, we first need a simple and accurate assay to evaluate viral protein expression in virally suppressed subjects. 
Design 
We optimized an HIV Nef enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) and used it to quantify plasma Nef levels as an indicator of the leaky HIV reservoir in an HIV-infected cohort. 
Methods 
This study accessed 134 plasma samples from a well-characterized cohort study of HIV-infected and uninfected adults in San Francisco (the SCOPE cohort). We optimized an ELISA for detection of plasma Nef in HIV-negative subjects and HIV-infected non-controllers, and evaluated its utility to quantify plasma Nef levels in a cross-sectional study of ART-suppressed and elite controller HIV-infected subjects. 
Results 
Here, we describe the performance of an optimized HIV Nef ELISA. When we applied this assay to the study cohort we found that plasma Nef levels were correlated with plasma HIV RNA levels in untreated disease. However, we were able to detect Nef in plasma of approximately half of subjects on ART or with elite control, despite the lack of detectable plasma HIV RNA levels using standard assays. Plasma Nef levels were not consistently associated with CD4+ T-cell count, CD8+ T-cell count, self-reported nadir CD4+ T-cell count or the CD4+/CD8+ T-cell ratio in HIV-infected subjects. 
Conclusion 
Since plasma HIV RNA levels are undetectable in virally suppressed subjects, it is reasonable to assume that viral protein expression in leaky reservoir, and not plasma virions, is the source of Nef accumulating in plasma. To examine this further, improvements of the assay sensitivity, by lowering the background through improvements in the quality of Nef antibodies, and detailed characterization of the HIV reservoirs are needed.</Opis>
  <TujJezik_Opis></TujJezik_Opis>
  <KljucneBesede>
    <Beseda>viral protein Nef</Beseda>
    <Beseda>plasma</Beseda>
    <Beseda>HIV</Beseda>
  </KljucneBesede>
  <TujJezik_KljucneBesede>
    <Beseda>virusni protein Nef</Beseda>
    <Beseda>plazma</Beseda>
    <Beseda>HIV</Beseda>
  </TujJezik_KljucneBesede>
  <Potrjeno>true</Potrjeno>
  <JeZaklenjeno>false</JeZaklenjeno>
  <JeRecenzirano>true</JeRecenzirano>
  <Zaloznik></Zaloznik>
  <Izvor></Izvor>
  <Jezik ID="1033" ISO639-3="eng">Angleški jezik</Jezik>
  <TujJezik ID="1060" ISO639-3="slv">Slovenski jezik</TujJezik>
  <Povezave></Povezave>
  <Pokrivanje></Pokrivanje>
  <CasovnoPokritje></CasovnoPokritje>
  <AvtorskePravice></AvtorskePravice>
  <VrstaGradiva ID="dk_c" DRIVER="info:eu-repo/semantics/article">Članek v reviji</VrstaGradiva>
  <DatumVstavljanja>2021-07-26 15:12:10</DatumVstavljanja>
  <DatumObjave>2021-07-26 15:12:16</DatumObjave>
  <DatumSpremembe>2022-09-07 04:16:54</DatumSpremembe>
  <DatumTrajnegaHranjenja>0000-00-00 00:00:00</DatumTrajnegaHranjenja>
  <LetoIzida>2018</LetoIzida>
  <LetoIzidaDo>0</LetoIzidaDo>
  <KrajIzida></KrajIzida>
  <LetoIzvedbe>0</LetoIzvedbe>
  <KrajIzvedbe></KrajIzvedbe>
  <Opomba></Opomba>
  <StStrani>10 str.</StStrani>
  <StevilcenjeNivo1>iss. 1, art. e0191613</StevilcenjeNivo1>
  <StevilcenjeNivo2>Vol. 13</StevilcenjeNivo2>
  <Kronologija>Jan. 2018</Kronologija>
  <Patent_Stevilka></Patent_Stevilka>
  <Patent_DatumVeljavnosti>0000-00-00</Patent_DatumVeljavnosti>
  <VerzijaDokumenta>Zaloznikova</VerzijaDokumenta>
  <StatusObjaveDrugje>Objavljeno</StatusObjaveDrugje>
  <VrstaStroskaObjave>NiDoloceno</VrstaStroskaObjave>
  <DatumPoslanoVRecenzijo>0000-00-00</DatumPoslanoVRecenzijo>
  <DatumSprejetjaClanka>0000-00-00</DatumSprejetjaClanka>
  <DatumObjaveClanka>0000-00-00</DatumObjaveClanka>
  <Licence>
    <Licenca ID="6" Kratica="CC BY 4.0" Naziv="Creative Commons Priznanje avtorstva 4.0 Mednarodna" URL="http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/deed.sl" Logo="by.png" LogoPolniUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/teme/rulDev/img/licence/by.png" DatumZacetkaLicenciranja="2018-01-24" VezanoNa="" VezanoNaAng="" Besedilo="" BesediloAng=""></Licenca>
  </Licence>
  <EmbargoDo></EmbargoDo>
  <VrstaEmbarga ID="1" Naziv="Takojšnja javna objava" OpenAIREDostop="openAccess"></VrstaEmbarga>
  <Osebe>
    <Oseba ID="34408" Ime="Jana" Priimek="Ferdin" AltIme="J. Ferdin; J Ferdin" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="126364771" Afiliacija="" ArrsID="30767" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="39250" Ime="Katja" Priimek="Goričar" AltIme="K. Goricar; K. Goričar; Katja Goricar; K Goričar" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="183683171" Afiliacija="" ArrsID="33110" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="15367" Ime="Vita" Priimek="Dolžan" AltIme="Vita Dovžan; Vita Dolzan; V. Dolzan; V. Dolžan; V Dolžan" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="3545699" Afiliacija="" ArrsID="11711" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="16237" Ime="Ana" Priimek="Plemenitaš" AltIme="Ana Plemenitas; A. Plemenitaš; A Plemenitaš" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="2680419" Afiliacija="" ArrsID="06777" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="105312" Ime="Jeffrey" Priimek="Martin" AltIme="Martin N. Jeffrey" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="211263331" Afiliacija="" ArrsID="" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="34316" Ime="Matija Boris" Priimek="Peterlin" AltIme="Matija Peterlin; Matija B. Peterlin; B.M. Peterlin; B. Matija Peterlin; Matija B Peterlin; BM Peterlin; Boris M. Peterlin" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="20130659" Afiliacija="" ArrsID="34721" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="105313" Ime="Steven G" Priimek="Deeks" AltIme="Stevèn G. Deeks; Steven G. Deeks; S. G. Deeks; SG Deeks" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="211262819" Afiliacija="" ArrsID="" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="35642" Ime="Metka" Priimek="Lenassi" AltIme="M. Lenassi; M Lenassi" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="29462371" Afiliacija="" ArrsID="24288" ORCID=""></Oseba>
  </Osebe>
  <Identifikatorji>
    <Identifikator ID="4" Sifra="UDK" Naziv="UDK" URL="">616.9</Identifikator>
    <Identifikator ID="9" Sifra="ISSN-clanka" Naziv="ISSN pri članku" URL="">1932-6203</Identifikator>
    <Identifikator ID="15" Sifra="DOI" Naziv="DOI" URL="http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0191613">10.1371/journal.pone.0191613</Identifikator>
    <Identifikator ID="3" Sifra="CobissID" Naziv="COBISS_ID" URL="https://plus.cobiss.net/cobiss/si/sl/bib/33608665">33608665</Identifikator>
  </Identifikatorji>
  <Datoteke>
    <Datoteka ID="145576" DatotekaNRID="11742341" NamenDatotekeID="2" NamenDatoteke="Predstavitvena datoteka" FormatDatotekeID="2" FormatDatoteke=".pdf" MIME="application/pdf" IkonaFormata="pdf.png" IkonaFormataPolniUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/teme/rulDev/img/fileTypes/pdf.png" VelikostDatoteke="5136733" VelikostDatotekeKratko="4,90 MB" DatumVstavljanja="2021-07-26 15:12:21" JeZbrisana="false" JeJavnoVidna="true" JeIndeksirana="true" JeVidno="true" VidnoOd="01.01.1970" Zaporedje="0">
      <Naziv>RAZ_Ferdin_Jana_2018.pdf</Naziv>
      <OrgNaziv>RAZ_Ferdin_Jana_2018.pdf</OrgNaziv>
      <URL></URL>
      <Opis></Opis>
      <OpisTujJezik></OpisTujJezik>
      <UrlObdelave></UrlObdelave>
      <FrekvencaAzuriranjaID>1</FrekvencaAzuriranjaID>
      <Verzija></Verzija>
      <MD5>327819D23F5FE231DFF67DC9F23F2594</MD5>
      <SHA256>f557d8926f2f9eeb94f70170ac0d8218ca382bc8f84cedc3bcdcdbf85e7497a2</SHA256>
      <UUID>f0cb7e85-ee12-11eb-a523-00155dcfd717</UUID>
      <PID></PID>
      <PrenosPolniUrl>https://repozitorij.uni-lj.si/Dokument.php?lang=slv&amp;id=145576</PrenosPolniUrl>
      <Vsebine>
        <Vsebina TipVsebine="GoloBesedilo" JezikID="1033" Oznaka="" Dolzina="32789"></Vsebina>
      </Vsebine>
    </Datoteka>
    <Datoteka ID="145577" DatotekaNRID="0" NamenDatotekeID="5" NamenDatoteke="Izvorni URL" FormatDatotekeID="56" FormatDatoteke="URL" MIME="text/url" IkonaFormata="url.png" IkonaFormataPolniUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/teme/rulDev/img/fileTypes/url.png" VelikostDatoteke="0" VelikostDatotekeKratko="0,00 KB" DatumVstavljanja="2021-07-26 15:20:34" JeZbrisana="false" JeJavnoVidna="true" JeIndeksirana="false" JeVidno="true" VidnoOd="01.01.1970" Zaporedje="2">
      <Naziv></Naziv>
      <OrgNaziv></OrgNaziv>
      <URL>https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0191613</URL>
      <Opis></Opis>
      <OpisTujJezik></OpisTujJezik>
      <UrlObdelave></UrlObdelave>
      <FrekvencaAzuriranjaID>0</FrekvencaAzuriranjaID>
      <Verzija></Verzija>
      <MD5></MD5>
      <SHA256></SHA256>
      <UUID>1700d090-ee14-11eb-a523-00155dcfd717</UUID>
      <PID></PID>
      <PrenosPolniUrl>https://repozitorij.uni-lj.si/Dokument.php?lang=slv&amp;id=145577</PrenosPolniUrl>
      <Vsebine>
      </Vsebine>
    </Datoteka>
  </Datoteke>
  <Organizacije>
    <Organizacija OrganizacijaID="18" Kratica="MF" ZavodEvsID="0000072" Logo="" LogoPolniUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/teme/rulDev/img/logo/">Medicinska fakulteta </Organizacija>
  </Organizacije>
  <OrganizacijeVira>
  </OrganizacijeVira>
  <MetodeZbiranjaPodatkov>
  </MetodeZbiranjaPodatkov>
  <TipologijaDela ID="1.01" Koda="1.01" Naziv="Izvirni znanstveni članek" SchemaOrg="Article"></TipologijaDela>
  <OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/ARRS//Z3-7198" Stevilka="Z3-7198" Naslov="Identifikacija in ovrednotenje novih biooznačevalcev za delno aktivne rezervoarje virusa HIV." Akronim="" Delez="12"></OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/ARRS//J3-5499" Stevilka="J3-5499" Naslov="Nef, izločen z eksosomi iz celic okuženih z virusom HIV, pomembno prispeva k razvoju nevroloških simptomov AIDS-a" Akronim="" Delez="11"></OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/ARRS//P1-0170" Stevilka="P1-0170" Naslov="Molekulski mehanizmi uravnavanja celičnih procesov v povezavi z nekaterimi boleznimi pri človeku" Akronim="" Delez="11"></OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/other/UCSF/Gladstone Institute of Virology &amp; Immunology CFAR/P30%20AI027763" Stevilka="P30 AI027763" Naslov="" Akronim="" Delez="11"></OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/other/CFAR Network of Integrated Systems/R24%20AI067039" Stevilka="R24 AI067039" Naslov="" Akronim="" Delez="11"></OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/other/Delaney AIDS Research Enterprise/AI096109" Stevilka="AI096109" Naslov="" Akronim="" Delez="11"></OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/other/Delaney AIDS Research Enterprise/A127966" Stevilka="A127966" Naslov="" Akronim="" Delez="11"></OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/other/amfAR Institute for HIV Cure Research/amfAR%20109301" Stevilka="amfAR 109301" Naslov="" Akronim="" Delez="11"></OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/NIH//R01%20AI49104" Stevilka="R01 AI49104" Naslov="" Akronim="" Delez="11"></OpenAIRE>
  </OpenAIRE>
  <Ostalo>
    <StIrodsDatotek>0</StIrodsDatotek>
    <StDatotekPodTrajnimEmbargom>0</StDatotekPodTrajnimEmbargom>
    <StDatotekZOmejenimDostopom>0</StDatotekZOmejenimDostopom>
  </Ostalo>
</Gradivo>
