<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<Gradivo ID="128258" NadgradivoID="1968" NRID="13112528" OceID="0" DomainUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/" IzpisPolniUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?lang=slv&amp;id=128258" StOgledov="2326" StPrenosov="593" StOcen="0" VsotaOcen="0" DatumIzvoza="2026-09-15 09:06:32" OcenaSkupna="0" StPodgradiv="0" StudijskiProgramEvsID="" JeIndeksirano="0" JeVecAvtorjev="0" DovoliZahtevkeZaDostop="0">
  <PID Url="http://hdl.handle.net/20.500.12556/RUL-128258">20.500.12556/RUL-128258</PID>
  <Naslov>Mapping the gene expression spectrum of mediator subunits in response to viroid infection in plants</Naslov>
  <Podnaslov></Podnaslov>
  <TujJezik_Naslov></TujJezik_Naslov>
  <TujJezik_Podnaslov></TujJezik_Podnaslov>
  <Opis>The mediator (MED) represents a large, conserved, multi-subunit protein complex that regulates gene expression through interactions with RNA polymerase II and enhancer-bound transcription factors. Expanding research accomplishments suggest the predominant role of plant MED subunits in the regulation of various physiological and developmental processes, including the biotic stress response against bacterial and fungal pathogens. However, the involvement of MED subunits in virus/viroid pathogenesis remains elusive. In this study, we investigated for the first time the gene expression modulation of selected MED subunits in response to five viroid species (Apple fruit crinkle viroid (AFCVd), Citrus bark cracking viroid (CBCVd), Hop latent viroid (HLVd), Hop stunt viroid (HSVd), and Potato spindle tuber viroid (PSTVd)) in two model plant species (Nicotiana tabacum and N. benthamiana) and a commercially important hop (Humulus lupulus) cultivar. Our results showed a differential expression pattern of MED subunits in response to a viroid infection. The individual plant MED subunits displayed a differential and tailored expression pattern in response to different viroid species, suggesting that the MED expression is viroid- and plant species-dependent. The explicit evidence obtained from our results warrants further investigation into the association of the MED subunit with symptom development. Together, we provide a comprehensive portrait of MED subunit expression in response to viroid infection and a plausible involvement of MED subunits in fine-tuning transcriptional reprogramming in response to viroid infection, suggesting them as a potential candidate for rewiring the defense response network in plants against pathogens.</Opis>
  <TujJezik_Opis></TujJezik_Opis>
  <KljucneBesede>
    <Beseda>differential expression</Beseda>
    <Beseda>hop</Beseda>
    <Beseda>mediator complex</Beseda>
    <Beseda>Nicotiana benthamiana</Beseda>
    <Beseda>Nicotiana tabacum</Beseda>
    <Beseda>pathogen</Beseda>
    <Beseda>quantitative reverse transcription PCR</Beseda>
    <Beseda>viroid</Beseda>
  </KljucneBesede>
  <TujJezik_KljucneBesede>
    <Beseda>hmelj</Beseda>
    <Beseda>genetika</Beseda>
    <Beseda>izražanje genov</Beseda>
    <Beseda>Nicotiana benthamiana</Beseda>
    <Beseda>Nicotiana tabacum</Beseda>
    <Beseda>patogeni</Beseda>
    <Beseda>viroidi</Beseda>
    <Beseda>kvantitativna genetika</Beseda>
    <Beseda>kvantitativna reverzna transkripcija</Beseda>
    <Beseda>PCR</Beseda>
  </TujJezik_KljucneBesede>
  <Potrjeno>true</Potrjeno>
  <JeZaklenjeno>false</JeZaklenjeno>
  <JeRecenzirano>true</JeRecenzirano>
  <Zaloznik></Zaloznik>
  <Izvor></Izvor>
  <Jezik ID="1033" ISO639-3="eng">Angleški jezik</Jezik>
  <TujJezik ID="1060" ISO639-3="slv">Slovenski jezik</TujJezik>
  <Povezave></Povezave>
  <Pokrivanje></Pokrivanje>
  <CasovnoPokritje></CasovnoPokritje>
  <AvtorskePravice></AvtorskePravice>
  <VrstaGradiva ID="dk_c" DRIVER="info:eu-repo/semantics/article">Članek v reviji</VrstaGradiva>
  <DatumVstavljanja>2021-07-07 14:09:44</DatumVstavljanja>
  <DatumObjave>2021-07-07 14:09:45</DatumObjave>
  <DatumSpremembe>2022-09-07 04:14:01</DatumSpremembe>
  <DatumTrajnegaHranjenja>0000-00-00 00:00:00</DatumTrajnegaHranjenja>
  <LetoIzida>2020</LetoIzida>
  <LetoIzidaDo>0</LetoIzidaDo>
  <KrajIzida></KrajIzida>
  <LetoIzvedbe>0</LetoIzvedbe>
  <KrajIzvedbe></KrajIzvedbe>
  <Opomba></Opomba>
  <StStrani>10 str.</StStrani>
  <StevilcenjeNivo1>iss. 7, art. 2498</StevilcenjeNivo1>
  <StevilcenjeNivo2>Vol. 21</StevilcenjeNivo2>
  <Kronologija>2020</Kronologija>
  <Patent_Stevilka></Patent_Stevilka>
  <Patent_DatumVeljavnosti>0000-00-00</Patent_DatumVeljavnosti>
  <VerzijaDokumenta>Zaloznikova</VerzijaDokumenta>
  <StatusObjaveDrugje>Objavljeno</StatusObjaveDrugje>
  <VrstaStroskaObjave>NiDoloceno</VrstaStroskaObjave>
  <DatumPoslanoVRecenzijo>0000-00-00</DatumPoslanoVRecenzijo>
  <DatumSprejetjaClanka>0000-00-00</DatumSprejetjaClanka>
  <DatumObjaveClanka>0000-00-00</DatumObjaveClanka>
  <Licence>
    <Licenca ID="6" Kratica="CC BY 4.0" Naziv="Creative Commons Priznanje avtorstva 4.0 Mednarodna" URL="http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/deed.sl" Logo="by.png" LogoPolniUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/teme/rulDev/img/licence/by.png" DatumZacetkaLicenciranja="2020-04-01" VezanoNa="" VezanoNaAng="" Besedilo="" BesediloAng=""></Licenca>
  </Licence>
  <EmbargoDo></EmbargoDo>
  <VrstaEmbarga ID="1" Naziv="Takojšnja javna objava" OpenAIREDostop="openAccess"></VrstaEmbarga>
  <Osebe>
    <Oseba ID="104770" Ime="Vishnu Sukumari" Priimek="Nath" AltIme="Vishnu Sukumari Nath" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="318254691" Afiliacija="" ArrsID="" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="104771" Ime="Ankita" Priimek="Shrestha" AltIme="" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="337950819" Afiliacija="" ArrsID="" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="104772" Ime="Praveen" Priimek="Awasthi" AltIme="" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="337949539" Afiliacija="" ArrsID="" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="104773" Ime="Ajay" Priimek="Kumar Mishra" AltIme="Ajay Kumar Mishra; A. K. Mishra" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="269076323" Afiliacija="" ArrsID="" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="104774" Ime="Tomáš" Priimek="Kocábek" AltIme="T. Kocábek" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="236736099" Afiliacija="" ArrsID="" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="104775" Ime="Jaroslav" Priimek="Matoušek" AltIme="J. Matoušek; Jaroslav Matousek; J. Matousek" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="225917539" Afiliacija="" ArrsID="" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="104776" Ime="Andrej" Priimek="Sečnik" AltIme="" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="298835555" Afiliacija="" ArrsID="53626" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="711" Ime="Jernej" Priimek="Jakše" AltIme="J. Jakse; J. Jakše; Jernej Jakse; Nejc Jakše" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="4421475" Afiliacija="" ArrsID="16379" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="1256" Ime="Sebastjan" Priimek="Radišek" AltIme="S. Radišek; S. Radisek; Sebastjan Radisek; Sebastijan Radišek" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="4910691" Afiliacija="" ArrsID="20162" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="104777" Ime="Vipin" Priimek="Hallan" AltIme="" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="341081443" Afiliacija="" ArrsID="" ORCID=""></Oseba>
  </Osebe>
  <Identifikatorji>
    <Identifikator ID="4" Sifra="UDK" Naziv="UDK" URL="">577.2</Identifikator>
    <Identifikator ID="9" Sifra="ISSN-clanka" Naziv="ISSN pri članku" URL="">1422-0067</Identifikator>
    <Identifikator ID="15" Sifra="DOI" Naziv="DOI" URL="http://dx.doi.org/10.3390/ijms21072498">10.3390/ijms21072498</Identifikator>
    <Identifikator ID="3" Sifra="CobissID" Naziv="COBISS_ID" URL="https://plus.cobiss.net/cobiss/si/sl/bib/9458041">9458041</Identifikator>
  </Identifikatorji>
  <Datoteke>
    <Datoteka ID="144938" DatotekaNRID="11739649" NamenDatotekeID="2" NamenDatoteke="Predstavitvena datoteka" FormatDatotekeID="2" FormatDatoteke=".pdf" MIME="application/pdf" IkonaFormata="pdf.png" IkonaFormataPolniUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/teme/rulDev/img/fileTypes/pdf.png" VelikostDatoteke="2019325" VelikostDatotekeKratko="1,93 MB" DatumVstavljanja="2021-07-07 14:12:32" JeZbrisana="false" JeJavnoVidna="true" JeIndeksirana="true" JeVidno="true" VidnoOd="07.07.2021" Zaporedje="1">
      <Naziv>RAZ_Nath_Vishnu_Sukumari_2020.pdf</Naziv>
      <OrgNaziv>RAZ_Nath_Vishnu_Sukumari_2020.pdf</OrgNaziv>
      <URL></URL>
      <Opis></Opis>
      <OpisTujJezik></OpisTujJezik>
      <UrlObdelave></UrlObdelave>
      <FrekvencaAzuriranjaID>1</FrekvencaAzuriranjaID>
      <Verzija></Verzija>
      <MD5>5E5C41D25A74D0BF99AE20916D9DB78D</MD5>
      <SHA256>ae77c3f9478d6946eb8c54d8d0483a3a416fc0f718ac292ef437493a24420a33</SHA256>
      <UUID>7873561d-df1c-11eb-a523-00155dcfd717</UUID>
      <PID></PID>
      <PrenosPolniUrl>https://repozitorij.uni-lj.si/Dokument.php?lang=slv&amp;id=144938</PrenosPolniUrl>
      <Vsebine>
        <Vsebina TipVsebine="GoloBesedilo" JezikID="1033" Oznaka="" Dolzina="37714"></Vsebina>
      </Vsebine>
    </Datoteka>
    <Datoteka ID="144937" DatotekaNRID="0" NamenDatotekeID="5" NamenDatoteke="Izvorni URL" FormatDatotekeID="56" FormatDatoteke="URL" MIME="text/url" IkonaFormata="url.png" IkonaFormataPolniUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/teme/rulDev/img/fileTypes/url.png" VelikostDatoteke="0" VelikostDatotekeKratko="0,00 KB" DatumVstavljanja="2021-07-07 14:11:07" JeZbrisana="false" JeJavnoVidna="true" JeIndeksirana="false" JeVidno="true" VidnoOd="01.01.1970" Zaporedje="1">
      <Naziv></Naziv>
      <OrgNaziv></OrgNaziv>
      <URL>https://www.mdpi.com/1422-0067/21/7/2498</URL>
      <Opis></Opis>
      <OpisTujJezik></OpisTujJezik>
      <UrlObdelave></UrlObdelave>
      <FrekvencaAzuriranjaID>0</FrekvencaAzuriranjaID>
      <Verzija></Verzija>
      <MD5></MD5>
      <SHA256></SHA256>
      <UUID>45f5a79c-df1c-11eb-a523-00155dcfd717</UUID>
      <PID></PID>
      <PrenosPolniUrl>https://repozitorij.uni-lj.si/Dokument.php?lang=slv&amp;id=144937</PrenosPolniUrl>
      <Vsebine>
      </Vsebine>
    </Datoteka>
  </Datoteke>
  <Organizacije>
    <Organizacija OrganizacijaID="5" Kratica="BF" ZavodEvsID="0000057" Logo="" LogoPolniUrl="https://repozitorij.uni-lj.si/teme/rulDev/img/logo/">Biotehniška fakulteta </Organizacija>
  </Organizacije>
  <OrganizacijeVira>
  </OrganizacijeVira>
  <MetodeZbiranjaPodatkov>
  </MetodeZbiranjaPodatkov>
  <TipologijaDela ID="1.01" Koda="1.01" Naziv="Izvirni znanstveni članek" SchemaOrg="Article"></TipologijaDela>
  <OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/EC/Operational Programme Research, Development and Education/CZ.02.2.69%2F0.0%2F0.0%2F16_027%2F0008357" Stevilka="CZ.02.2.69/0.0/0.0/16_027/0008357" Naslov="" Akronim="MEMOBIC" Delez="33"></OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/ARRS//P4-0077" Stevilka="P4-0077" Naslov="Kmetijske rastline - genetika in sodobne tehnologije" Akronim="" Delez="33"></OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/other/Institute of Plant Molecular Biology/RVO%3A60077344" Stevilka="RVO:60077344" Naslov="" Akronim="" Delez="34"></OpenAIRE>
  </OpenAIRE>
  <Ostalo>
    <StIrodsDatotek>0</StIrodsDatotek>
    <StDatotekPodTrajnimEmbargom>0</StDatotekPodTrajnimEmbargom>
    <StDatotekZOmejenimDostopom>0</StDatotekZOmejenimDostopom>
  </Ostalo>
</Gradivo>
