20.500.12556/RUL-103094 Knowledge-constrained projection of high-dimensional data Projekcija visokodimenzionalnih podatkov ob upoštevanju domenskih omejitev Projection of high-dimensional data is usually done by reducing dimensionality of the data and transforming the data to the latent space. We created synthetic data to simulate real gene-expression datasets and we tested methods on both synthetic and real data. With this work we address the visualization of our data through implementation of regularized singular value decomposition (SVD) for biclustering using L0-norm and L1-norm. Additional knowledge is introduced to the model through regularization with the two prior adjacency matrices. We show that L0-norm SVD and L1-norm SVD give better results than standard SVD. Projekcija visokodimenzionalnih podatkov se običajno pripravi z zmanjšanjem dimenzionalnosti, ki se predstavi v latentnem prostoru, kar omogoča smiselno vizualizacijo. Pripravili smo sintetične podatke, ki odražajo gensko izražanje v pravih podatkovnih zbirkah. Metode smo kasneje testirali na pripravljenih sintetičnih in pravih podatkih. V tem delu smo obravnavali naloge z izvajanjem regularizirane SVD metode, z uporabo L0-norme in L1-norme. Modelu je bila dodana informacija z regularizacijo dveh dodatnih matrik sosednosti. Pokazali smo, da so te metode dale boljše rezultate kot standardni SVD. data projection latent spaces regularization data science single-cell genomics projekcija podatkov latentni prostori regularizacija podatkovna veda genomika posameznih celic true false false Angleški jezik Slovenski jezik Magistrsko delo/naloga 2018-09-13 15:30:07 2018-09-13 15:30:08 2022-08-16 03:39:57 0000-00-00 00:00:00 2018 0 0 0000-00-00 NiDoloceno NiDoloceno NiDoloceno 0000-00-00 0000-00-00 0000-00-00 1970-01-01 20961 Omanovic_Amra_-_Projekcija_visokodimenzionalnih_podatkov_ob_upostevanju_domenskih_omejitev.pdf Omanovic_Amra_-_Projekcija_visokodimenzionalnih_podatkov_ob_upostevanju_domenskih_omejitev.pdf 1 2209B6E38B67C67028DBBBEEA52CCC97 e04a8580d495cac78238f3ec37b67692463822d315cf61e286ba1847d4f5f632 b5ae1342-a1b5-11eb-a523-00155dcfd717 https://repozitorij.uni-lj.si/Dokument.php?lang=slv&id=113485 Fakulteta za računalništvo in informatiko 0 0 0