20.500.12556/RUL-103094
Knowledge-constrained projection of high-dimensional data
Projekcija visokodimenzionalnih podatkov ob upoštevanju domenskih omejitev
Projection of high-dimensional data is usually done by reducing dimensionality of the data and transforming the data to the latent space. We created synthetic data to simulate real gene-expression datasets and we tested methods on both synthetic and real data.
With this work we address the visualization of our data through implementation of regularized singular value decomposition (SVD) for biclustering using L0-norm and L1-norm. Additional knowledge is introduced to the model through regularization with the two prior adjacency matrices. We show that L0-norm SVD and L1-norm SVD give better results than standard SVD.
Projekcija visokodimenzionalnih podatkov se običajno pripravi z zmanjšanjem dimenzionalnosti, ki se predstavi v latentnem prostoru, kar omogoča smiselno vizualizacijo. Pripravili smo sintetične podatke, ki odražajo gensko izražanje v pravih podatkovnih zbirkah. Metode smo kasneje testirali na pripravljenih sintetičnih in pravih podatkih. V tem delu smo obravnavali naloge z izvajanjem regularizirane SVD metode, z uporabo L0-norme in L1-norme. Modelu je bila dodana informacija z regularizacijo dveh dodatnih matrik sosednosti. Pokazali smo, da so te metode dale boljše rezultate kot standardni SVD.
data projection
latent spaces
regularization
data science
single-cell genomics
projekcija podatkov
latentni prostori
regularizacija
podatkovna veda
genomika posameznih celic
true
false
false
Angleški jezik
Slovenski jezik
Magistrsko delo/naloga
2018-09-13 15:30:07
2018-09-13 15:30:08
2022-08-16 03:39:57
0000-00-00 00:00:00
2018
0
0
0000-00-00
NiDoloceno
NiDoloceno
NiDoloceno
0000-00-00
0000-00-00
0000-00-00
1970-01-01
20961
Omanovic_Amra_-_Projekcija_visokodimenzionalnih_podatkov_ob_upostevanju_domenskih_omejitev.pdf
Omanovic_Amra_-_Projekcija_visokodimenzionalnih_podatkov_ob_upostevanju_domenskih_omejitev.pdf
1
2209B6E38B67C67028DBBBEEA52CCC97
e04a8580d495cac78238f3ec37b67692463822d315cf61e286ba1847d4f5f632
b5ae1342-a1b5-11eb-a523-00155dcfd717
https://repozitorij.uni-lj.si/Dokument.php?lang=slv&id=113485
Fakulteta za računalništvo in informatiko
0
0
0