Genske skupine za biosintezo biološko aktivnih učinkovin iz skupine poliketid sintaze tipa 2Vrh, Staš (Avtor)
Petković, Hrvoje (Mentor)
biotehnologijapoliketidibiosintezaPKSaktinomiceteAktinomicete so glavni vir policikličnih aromatskih molekul, poznanih kot poliketidi tipa 2, med katerimi je tudi veliko klinično pomembnih antibiotikov in protirakastih učinkovin. Poliketidi tipa 2, kot so antraciklini, anguciklini in tetraciklini, tvorijo veliko skupino naravnih molekul z raznolikimi strukturami in biološkimi aktivnostmi. Sintetizirajo jih encimski kompleksi poliketid sintaze (PKS) tipa 2. Genske skupine PKS tipa 2 so sestavljene iz minimalnega PKS (ketosintazni heterodimer (KSα in KSβ) in »acyl carrier« proteina (ACP)) in drugih genov, ki sodelujejo pri biosintezi skeleta, kot so ketoreduktaze, ciklaze, aromataze ter encimov, ki katalizirajo t. i. pozne stopnje v biosintezi teh sekundarnih metabolitov. Raznolikost in kompleksnost genskih skupin za biosintezo poliketidov je zahtevala razvoj posebnih bioinformatskih orodji za identifikacijo, anotacijo in predikcijo kemijske strukture produkta genske skupine, za aktivacijo tihih genskih skupin pa so bile razvite posebne metode. Obstaja veliko primerov študij, ki potrjujejo, da neizkoriščeni viri kot so nekultivabilne bakterije predstavljajo bogat vir novih poliketidov. V obsegu te diplomske naloge smo povzeli potencialne pristope za študij genskih skupin za biosintezo poliketidov tipa 2.[S. Vrh]20182018-07-07 07:45:30Diplomsko delo/naloga101821UDK: 604.4:615.33(043.2)VisID: 151500COBISS_ID: 9005945sl