Analiza variabilnosti gena za eritropoetin pri družinski eritrocitozi.Prijatelj, Tinkara (Avtor) Debeljak, Nataša (Mentor) Kunej, Tanja (Komentor) eritropoetingenrazličice zaporedja DNAdoločanje nukleotidnega zaporedjaeritrocitozadružinska eritrocitozaEritrocitoza zajema heterogeno skupino motenj, ki se odražajo v povečanem številu eritrocitov. Družinska eritrocitoza (DE) je prirojena motnja z različnim genetskim ozadjem. Mutacije v eritropoinskem receptorju so značilne za primarno DE tipa 1, medtem ko so za sekundarne DE tipa 2-4 odgovorne mutacije v genih vključenih v biološko pot zaznavanja kisika ter regulacijo izražanja eritropoetina (EPO). Cilj magistrske naloge je bil pregledati objavljeno literaturo na področju razvoja DE v povezavi z različicami zaporedja DNA v genu EPO, s pomočjo bioinformacijskih orodij napovedati nove biooznačevalce in eksperimentalno preveriti različice v genu EPO pri dveh bolnikih s sumom na DE. V objavljenih kliničnih študijah smo našli šest različic v genu EPO, povezanih z eritrocitozo ali povišanim hematokritom. Poenotili smo heterogeno nomenklaturo zapisa različic zaporedja DNA. Orodji SIFT in PolyPhen predvidita največji škodljiv vpliv na funkcijo proteina za dodatnih sedem različic gena EPO. Analiza nukleotidnega zaporedja dveh bolnikov s sumom na DE je potrdila prisotnost različice zaporedja DNA v ojačevalcu gena EPO, vendar bi bilo z dodatnimi raziskavami potrebno potrditi vzročnost različice za pojav DE. Metoda je bila prenesena v klinično uporabo. Poleg tega bi bilo potrebno opredeliti vpliv ostalih različic v regulatornih regijah gena. Standardizirano poročanje povezav genotip-fenotip bi olajšala primerjavo med študijami in hitrejši razvoj področja.[T. Prijatelj]20182018-02-20 07:15:51Magistrsko delo/naloga99897UDK: 601.4:577.12:606:616-056.7(043.2)VisID: 150931COBISS_ID: 8931961sl