Vpliv filogenetske sorodnosti na horizontalni genski transfer med roji sevov Bacillus subtilisBelcijan, Katarina (Avtor) Mandić Mulec, Ines (Mentor) Štefanič, Polonca (Komentor) mikrobne združbeBacillus subtilisrojenje celicmedsebojno prepoznavanjesorodstvena diskriminacijahorizontalni genski transferSorodstvena diskriminacija (razlikovanje) je oblika socialnega vedenja, ko se predstavniki ene vrste vedejo različno do sorodnikov, kot do manj sorodnih predstavnikov. Tudi sevi Bacillus subtilis kažejo zmožnost sorodstvenega razlikovanja, ki se pokaže med rojenjem sevov na površini agarja. Roji nesorodnih (»nonkin«) sevov tvorijo mejno linijo, roji sorodnih (»kin«) sevov pa se združujejo v skupne roje. Med roji »nonkin« sevov prihaja na področju mejne linije do stresnega odziva in celo pobijanja. Na podlagi tega smo predpostavili, da interakcije med roji »nonkin« sevov sprožijo intenzivnejšo izmenjavo DNA na območju mejne linije kot je ta med »kin« sevi. V ta namen smo uporabili seve B. subtilis osamljene iz mikro-talnega okolja in z znano pripadnostjo sorodstvenim skupinam. Vsak sev smo označili z genom za odpornost proti antibiotiku (SpR ali CmR) in s fluorescenčnim označevalcem (cfp ali yfp). To je omogočilo, da smo lahko eksperimentalno sledili horizontalnemu prenosu DNA med sevi s selekcijo transformant odpornih na oba antibiotika. Naši rezultati kažejo, da je delež transformant višji na območju srečanja sevov iz različnih sorodstvenih skupin, kar je v skladu s postavljeno hipotezo. Tudi izražanje gena comGA, ki kodira transporter ComGA, odgovoren za privzem eDNA, je višje na območju srečanja rojev »nonkin« sevov v primerjavi z izražanjem tega gena na stiku »kin« rojev. Zunajcelična DNA (eDNA) je v primerljivi koncentraciji na območju srečanja »kin« in »non-kin« rojev. Vendar do izmenjave DNA med roji ne pride, če na površino agarja nanesemo DNAzo ali uporabimo mutante z okvarjeno kompetenco. Na podlagi tega lahko zaključimo, da je transformacija mehanizem, ki je odgovoren za horizontalni prenos genov med roji sevov.[K. Belcijan]20172017-10-26 07:15:13Magistrsko delo/naloga97483UDK: 579.22/.26:579.852.11VisID: 147076COBISS_ID: 4849016sl