Genotipizacija bakterije Chlamydia trachomatis s sekvenciranjemFerko, Marina (Avtor) Keše, Darja (Mentor) Turk, Martina (Recenzent) klamidijeChlamydia trachomatisspolno prenosljive bakterijske okužbegenotipizacijasekvenciranjegen ompAChlamydia trachomatis je obvezna znotrajcelična bakterija, za katero je značilen edinstven dvofazni razvojni krog. Zaradi prilagoditve na znotrajcelični parazitizem je družina Chlamydiaceae izgubila številne gene, kar je vodilo v zmanjševanje velikosti njihovega genoma. Serovari imajo genom velik približno 1 Mb. Sevi so razvrščeni v serovare na osnovi nukleotidnih razlik zaporedja v genu ompA, ki kodira poglavitno beljakovino zunanje membrane. Bakterija parazitira samo pri človeku in povzroča očesne in genitalne okužbe. Delimo jo lahko v tri biovare, ki slonijo na serovarih, en je povezan s trahomom (serovari A−C), drug z urogenitalnimi infekcijami (serovari D−K) in tretji z dimeljskim limfogranulomom (serovari L1−L3). Chlamydia trachomatis je najpogostejši bakterijski povzročitelj spolno prenosljivih bolezni v svetu. V magistrski nalogi nas je zanimalo, kateri genotipi C. trachomatis najpogosteje povzročajo okužbe. V raziskavi smo uporabili 126 izolatov C. trachomatis, pridobljenih iz kužnin bolnikov v letu 2014. Izvedli smo genotipizacijo gena ompA bakterije C. trachomatis s sekvenciranjem. Rezultati so pokazali, da je bil najbolj razširjen genotip E (51,6 %), sledil mu je genotip F (20,2 %), G (11,3 %), K (8,1 %), D (4%), J (2,4 %), H (0,8 %) in Ia ter Ja (0,8 %). Rezultati genotipizacije naše raziskave so bili primerljivi z nedavnimi rezultati različnih študijskih skupin v Evropi.[M. Ferko]20172017-10-02 15:55:47Magistrsko delo/naloga96461UDK: 579.61:616.98:579.882:577.2.088COBISS_ID: 4820344sl