Osamitev in karakterizacija bakterije Clostridium difficile iz prsti z domačih vrtovSmrke, Julija (Avtor) Ambrožič Avguštin, Jerneja (Mentor) Janežič, Sandra (Komentor) Clostridium difficileprstkompostPCR-ribotipClostridium difficile predstavlja enega najpomembnejših povzročiteljev črevesnih okužb, povezanih z zdravstvom, vse pogosteje pa je tudi vzrok driske v domačem okolju. Okolje domnevno predstavlja enega od potencialnih virov okužbe. Clostridium difficile je namreč prisotna v prsti, vodi, hrani in pri živalih. V našem delu smo se osredotočili na osamitev in karakterizacijo bakterije C. difficile iz prsti z domačih vrtov, natančneje na prst iz kompostnikov in zelenjavnih ter cvetličnih vrtov. Na 5 različnih lokacijah smo skupaj nabrali 25 vozorcev prsti. Prisotnost C. difficile smo dokazali na 4 od 5 lokacijah in v 12 od 25 vzorcev (48 %). Ugotovili smo, da je pogostnost in raznolikost PCR-ribotipov večja v prsti kompostnikov, v primerjavi s prstjo iz vrtov. Razlog temu smo pripisali življenjskim pogojem, naklonjenim anaerobnim organizmom, in dejstvu, da na kompostnike odlagamo različne organske odpadke, ki so lahko kontaminirani s sporami C. difficile. Skupno smo iz 12 pozitivnih vzorcev osamili 132 izolatov C. difficile, ki smo jih z metodo PCR-ribotipizacije (metodo izbora za genotipizacijo bakterije C. difficile) uvrstlili v 10 PCR-ribotipov, med katerimi sta prevladovala PCR-ribotipa SLO 239 (26,5 %) in 001/072 (20,5 %). Skupno so bili 4 od 10 PCR-ribotipov toksigeni, ti so 001/072, 005 in 081 (vsi trije toksinotip 0) in 023 (toksinotip IV). Nekateri genotipi, izolirani iz prsti so enaki kot tisti, ki se pojavljajo tudi pri ljudeh in živalih v Sloveniji. Naši rezultati kažejo, da okolje lahko predstavlja potencialni vir okužbe z bakterijo C. difficile.20172017-05-18 07:15:07Magistrsko delo/naloga92316VisID: 130692COBISS_ID: 4363599sl