Egerolizini kot označevalci zgodnje apoptoze in kot teranostiki v raziskavah raka sečnega mehurjaŽeželj, Luka (Avtor) apoptozabiooznačevalciegerolizinikardiolipinlipidne domenesfingomielinteranostikaurotelijski rakDoktorsko delo preučuje specifične interakcije egerolizinskih proteinov z različnimi lipidnimi domenami ter preverja njihov teranostični potencial. V okviru raziskave so nastali in se zbirali štirje glavni tipi podatkov. Numerični podatki zajemajo eksperimentalne meritve vezave, citotoksičnosti in sproščanja kalceina. Slikovni podatki vključujejo rezultate mikroskopije in grafike. Tekstovni podatki obsegajo zapiske poteka poskusov in rezultate analiz v besedilnih datotekah. Referenčni podatki so pridobljeni iz javnih zbirk kot so PDB, UniProt in PubChem ter vsebujejo podatke o strukturah proteinov in lipidov ter sekvencah v formatih PDB in FASTA. Novi eksperimentalni podatki so bili pridobljeni z nadzorovanimi laboratorijskimi poskusi in specializirano opremo. Uporabljena je bila površinska plazmonska resonanca za pridobivanje podatkov o kinetiki in specifičnosti vezave proteinov. Izvedeni so bili testi na in vitro modelih, in sicer testi selektivne citotoksičnosti za oceno permeabilizacije in viabilnosti celic. Za vizualizacijo vezave na membrane je bila uporabljena fluorescenčna mikroskopija, za visokoločljivostno opazovanje lipidnih veziklov pa transmisijska elektronska mikroskopija. Dodatno so bile izvedene fizikalno-kemijske analize, natančneje CD-spektropolarimetrija za analizo sekundarne strukture proteinov in meritve fluorescenčne anizotropije za preučevanje lastnosti lipidnih membran. Javno dostopni podatki o lipidih in proteinih so pri tem služili kot referenčna osnova, s katero so se neposredno primerjali na novo pridobljeni eksperimentalni rezultati.20262026-10-12 13:33:35Raziskovalni podatki189680slOddelek za biologijo, Biotehniške fakulteta, Univerza v Ljubljani, Slovenija; Inštitut za biologijo celice, Medicinska fakulteta, Univerza v Ljubljani, Slovenija / Department of Biology, Biotechnical Faculty, University of Ljubljana, Slovenia; Institute of Cell Biology, Faculty of Medicine, University of Ljubljana, SloveniaOd/From 2022-10-01 do/to 2026-07-30