Identifikacija vezavnih partnerjev rastlinskega analoga hormona T3 med proteini navadnega repnjakovcaSpruk, Teja (Avtor) Taler-Verčič, Ajda (Mentor) test »pull down«Arabidopsis thalianajodmasna spektrometrijatrijodotironin (T3)Ščitnična hormona trijodotironin (T3) in tiroksin oziroma tetrajodotironin (T4) imata pri človeku in drugih živalih pomembno vlogo pri uravnavanju razvoja, rasti in metabolizma. V zadnjih letih se pojavlja vse več dokazov, da so spojine, podobne ščitničnim hormonom, prisotne tudi v rastlinah, vendar njihova fiziološka vloga in molekularni mehanizmi delovanja še niso povsem pojasnjeni. Namen magistrske naloge je bil v modelni rastlini navadni repnjakovec (Arabidopsis thaliana) identificirati potencialne proteine, ki vežejo hormon T3. V okviru eksperimentalnega dela smo T3 imobilizirali na magnetne kroglice in izvedli test »pull down« z uporabo lizata rastline A. thaliana. Elucijske frakcije smo poslali na analizo z masno spektrometrijo, identificirane proteine pa funkcionalno razvrstili na podlagi podatkov iz podatkovne zbirke UniProt. Poleg tega smo pripravili fluorescenčno označen T3 z barvilom Alexa Fluor 488, ga inkubirali z rastlinskim lizatom ter z nativno gelsko elektroforezo analizirali vezavo označenega hormona na rastlinske proteine. Analiza z masno spektrometrijo je omogočila identifikacijo več kot sto proteinov, med katerimi smo z uporabo različnih statističnih pristopov določili osem najbolj prepričljivih kandidatov. Med njimi so bili proteini, povezani s signalizacijo, membranskimi procesi, odzivom na stres, proteinsko homeostazo in metabolizmom lipidov. Neposredne vezave T3 na posamezne identificirane proteine v okviru te raziskave nismo eksperimentalno potrdili. Rezultati zato predstavljajo nabor perspektivnih kandidatov za nadaljnje raziskave in pomemben prvi korak k razumevanju možne vloge ščitničnim hormonom podobnih spojin ter njihovih potencialnih tarčnih proteinov v rastlinah.20262026-09-16 09:55:01Magistrsko delo/naloga187927VisID: 25543sl