Izvor in analiza sevov bakterije Escherichia coli, izoliranih iz pritokov, iztoka in vode Blejskega jezeraKošmrlj, Nuša (Avtor) Ambrožič Avguštin, Jerneja (Mentor) Čremožnik Zupančič, Jerneja (Komentor) E. coliBlejsko jezerogeni za dejavnike virulencesezonska dinamikaqPCREscherichia coli (E. coli) je genetsko raznolika bakterijska vrsta, običajno povezana s črevesnim mikrobiomom toplokrvnih živali, čeprav rezultati nedavnih študij nakazujejo, da lahko nekateri sevi preživijo in se razmnožujejo tudi v okolju. Znotraj vrste se sevi razlikujejo po prisotnosti genov za dejavnike virulence, zaradi česar lahko predstavljajo različno zdravstveno tveganje za ljudi in živali. Blejsko jezero, eno najbolj obiskanih alpskih jezer v Sloveniji, je zaradi turizma, kmetijske dejavnosti in poselitve v prispevnem območju, izpostavljeno vnosu različnih mikroorganizmov, tudi E. coli. V magistrskem delu smo preučili raznolikost in potencialno patogenost izolatov E. coli, osamljenih iz vode Blejskega jezera, njegovih pritokov in iztoka. Skupno smo osamili 1543 izolatov E. coli, pri katerih smo z metodo ERIC-PCR in filogenetskim razvrščanjem po prenovljeni metodi Clermont in sod. (2013) določili klonalnost ter filogenetsko pripadnost. Za nadaljnjo analizo smo izbrali 745 neklonalnih izolatov, pri katerih smo z metodo PCR preverili prisotnost izbranih genov za dejavnike virulence, ter ugotavljali hemolitično aktivnost in sposobnost razgradnje laktoze. Največ neklonalnih izolatov je bilo osamljenih iz pritokov (79,73 %) v času nekopalne sezone (75,30 %) ter uvrščenih v filogenetski skupini B1 (27,92 %) in A (25,50 %). Pri vseh izolatih smo potrdili vsaj en gen za dejavnik virulence, med vsemi analiziranimi geni pa je bil najpogosteje zaznan gen fimH (93,56 %), sledili pa so mu geni irp2, fluA, traT in kpsMTII. Večina genov, povezanih z dejavniki virulence, je bila pogosteje prisotna pri izolatih iz pritokov, kar kaže na pomemben vpliv zunanjih virov onesnaženja. Prisotnost potencialnega fekalnega onesnaženja v pritokih smo dodatno potrdili z uporabo označevalca GenBac3 in metodo qPCR. Skupni rezultati raziskave kažejo, da pritoki predstavljajo pomemben vir vnosa potencialno virulentnih sevov E. coli v Blejsko jezero skozi celo leto, pri čemer na njihovo pojavnost pomembno vplivajo različni antropogeni dejavniki, predvsem kmetijska dejavnost, neurejenost odvajanja komunalne vode ter sezonsko pogojene človekove aktivnosti.[N. Košmrlj]20262026-09-09 07:17:32Magistrsko delo/naloga187070UDK: 579.68(285Blejsko jezero)(043.2)VisID: 287557COBISS_ID: 290478851sl