Karakterizacija genomov amdoparvovirusov mačjih pand ter analiza viroma v fekalnih vzorcih mačjih pand iz evropskih živalskih vrtovPerović, Matija (Avtor) Kuhar, Urška (Mentor) mačji pandaAilurus fulgensamdoparvovirusRpAPVNGSfekalni viromAnalizirali smo 27 vzorcev fecesa mačjih pand in dva vzorca tkiv poginulih mačjih pand iz evropskih živalskih vrtov, pri katerih smo s PCR ugotovili prisotnost RpAPV. Z uporabo NGS ter sekvenciranja po Sangerju smo uspešno sestavili pet skoraj celih genomov ter 19 odsekov genov NS in VP RpAPV. Z uporabo programa MEGA12 smo opravili filogenetsko analizo, ki je pokazala, da vsi sevi pripadajo vrsti Amdoparvovirus carnivoran 5, oblikujejo pa svojo filogenetsko linijo znotraj te vrste. Virusa nam ni uspelo izolirati na celičnih linijah. Z uporabo NGS smo določili prisotnost ter zastopanost virusnih družin v fecesu mačjih pand. Rezultati kažejo na dominantno prisotnost štirih fagnih družin (Herelleviridae, Myoviridae, Podoviridae, Siphoviridae) ter štirih družin sesalskih virusov (Circoviridae, Picobirnaviridae, Orthomyxoviridae, Parvoviridae), kar se sklada z rezultati prejšnjih raziskav fekalnega viroma in mikrobioma mačjih pand.[M. Perović]20262026-09-04 07:17:25Magistrsko delo/naloga186660UDK: 578.5:599.74VisID: 286859COBISS_ID: 290021123sl