Identifikacija tarčnih neoantigenov s transkriptomskim profiliranjem glioblastomovKert, Špela (Avtor) Zupan, Andrej (Avtor) glioblastomtranskriptomtumorski antigenibioinformatikaGlioblastom (GB) je najpogostejši in najagresivnejši primarni možganski tumor pri odraslih, za katerega je značilna slaba prognoza, saj petletno preživetje znaša približno pet odstotkov. Diagnoza temelji na histopatoloških in molekularnih značilnostih, pri čemer slednje postajajo vse pomembnejše za opredelitev bolezni, izbiro zdravljenja in napoved izida. Kljub napredku v razumevanju molekularne biologije GB terapevtski pristopi v zadnjih letih ostajajo večinoma nespremenjeni. V ospredje sodobnih raziskav prihaja imunoterapija, katere učinkovitost pri GB omejuje izrazito imunosupresivno tumorsko mikrookolje. Med obetavne pristope sodijo tumorska cepiva, ki temeljijo na različnih platformah, vključno z dendritičnimi celicami, virusnimi vektorji, nukleinskimi kislinami in peptidi. Pristopi s peptidi temeljijo na identifikaciji tumorskih antigenov, ki jih glede na izvor delimo na tumor-specifične antigene (TSA) in tumorjem povezane antigene (TAA). TSA izvirajo iz somatskih genetskih sprememb in so praviloma specifični za posameznega bolnika, kar omogoča visoko selektivnost, vendar je njihovo število pri tumorjih z nizkim mutacijskim bremenom pogosto omejeno. Nasprotno so TAA posledica spremenjenega izražanja genov v tumorju in so lahko prisotni pri več bolnikih, vendar z manjšo tumorsko specifičnostjo. Posebno podskupino predstavljajo tumor-modni antigeni (CTA), ki se v normalnih pogojih izražajo omejeno in zato predstavljajo potencialno bolj varne tarče. Ključno vlogo pri predstavitvi tumorskih antigenov imajo molekule humanih levkocitnih antigenov (HLA), ki omogočajo vezavo peptidov in njihovo predstavitev na površini tumorskih celic. Le del identificiranih peptidov sproži učinkovit imunski odziv, zato je napoved imunogenih antigenov kompleksen proces, ki zahteva integracijo več bioloških in bioinformatskih pristopov. V okviru doktorske raziskave so bili zbrani podatki, ki vključujejo transkriptomske podatke GB (IDH-divji tip, gradus IV), pridobljene iz retrospektivno zbranih arhivskih tumorskih vzorcev. Namen raziskave je bil identificirati potencialne tumorske antigene, primerjati različne vire tumorskih antigenov (TSA, TAA, CNV, genske fuzije) in ovrednotiti njihov potencial za uporabo v personalizirani imunoterapiji.20262026-07-28 06:36:57Neznano185195sl