Primerjava genomske asociacijske študije celega genoma (GWAS) in rekombinantnega mapiranja v raziskavah kompleksnih genetskih lastnosti rastlinBabnik, Peter (Avtor) Jakše, Jernej (Mentor) kompleksne lastnosti v rastlinahGWASrekombinantno mapiranjemarkerjipopulacijeV diplomski nalogi primerjamo asociacijsko študijo celotnega genoma (GWAS) in rekombinantno mapiranje lokusov kvantitativnih lastnosti (QTL) pri rastlinah. Metodi se razlikujeta po tipu uporabljenih populacij, ločljivosti, statistični moči, občutljivosti na populacijsko strukturo ter času raziskave. GWAS uporablja naravne populacije ali diverzitetne panele s kratkim dosegom LD, kar omogoča visoko ločljivost in hkratno detekcijo več lokusov, vendar je občutljiv na populacijsko stratifikacijo in sorodnost, zato zahteva ustrezne statistične korekcije in ponovitve v različnih okoljih. Rekombinantno mapiranje temelji na dvostarševskih populacijah, pri katerih sta znana vrsta križanja in genotipa staršev, kar ima za posledico nižjo ločljivost in večjo statistično moč za detekcijo redkih alelov. Ponovljivost v različnih okoljih omogočajo trajne, pretežno homozigotne populacije, ločljivost pa se dodatno izboljša z večstarševskimi populacijami. Metodi sta med seboj komplementarni, saj GWAS omogoča hitro zaznavanje kandidatskih regij, rekombinantno mapiranje pa te detekcije potrdi in oceni učinke QTL na kompleksne lastnosti. Njuna skupna uporaba pospeši identifikacijo genov in njihovo uvajanje v žlahtniteljske programe.20252025-09-18 07:16:37Diplomsko delo/naloga173485VisID: 264804COBISS_ID: 249516291sl