Modeliranje metabolizma duktalnega adenokarcinoma na ravni genomaPetrovič, Filip (Avtor) Moškon, Miha (Mentor) Transkriptomikakontekstnospecifični metabolni modeli na nivoju genomaftINITprotein MAGE-A3Rak trebušne slinavke je ena najbolj smrtonosnih vrst raka, s stopnjo umrljivosti, ki dosega skoraj 95 %. V pomembnem deležu primerov se tumorji razvijejo v eksokrinih izvodilih trebušne slinavke, kar bolezen klasificira kot duktalni adenokarcinom trebušne slinavke (PDAC, angl. pancreatic ductal adenocarcinoma). Zaradi asimptomatske narave te bolezni v zgodnjih fazah in pomanjkanja učinkovitih metod odkrivanja, je PDAC pogosto diagnosticiran šele v naprednih stadijih, kar omejuje možnosti zdravljenja in prispeva k slabši prognozi bolnikov. Globlje razumevanje presnovnih sprememb, povezanih z rakom trebušne slinavke, je ključno za razjasnitev napredovanja in zgodnjega odkrivanja bolezni. V sklopu diplomskega dela smo uporabili transkriptomske podatke bolnikov s PDAC za postavitev kontekstnospecifičnih metabolnih modelov na nivoju genoma (GEMs, angl. genome-scale metabolic models) s pomočjo algoritma ftINIT (angl. fast task-driven integrative network inference for tissues). Algoritem ftINIT smo sistematično uporabili na različnih kombinacijah vhodnih podatkov, da bi identificirali optimalne parametre za generiranje biološko relevantnih presnovnih modelov. Poleg tega smo raziskali presnovni vpliv prekomernega izražanja melanomskega antigena A3 (MAGE-A3) v pankreatičnih rakastih celicah. MAGE-A3 sodeluje pri tumorigenezi, njegovo prekomerno izražanje v tumorskih celicah je povezana s slabšimi kliničnimi izidi, vendar njegova vloga v metabolizmu rakastih celic ostaja slabo raziskana. S karakterizacijo presnovnih posledic povečanega izražanja MAGE-A3 smo želeli pridobiti nova spoznanja o njegovem možnem funkcionalnem vplivu na metabolizem pankreatičnih rakastih celic, kar bi lahko odprlo pot nadaljnjim raziskavam njegove vloge v napredovanju bolezni.20252025-09-03 11:35:03Diplomsko delo/naloga171844VisID: 25359COBISS_ID: 252557571sl