Transpozoni kot orodja za genetske raziskaveTrontelj, Tinkara (Avtor) Jakše, Jernej (Mentor) transpozonigenetikagenetske raziskavebioinformatska analizasekvenciranjeTranspozoni, mobilni genetski elementi, so vplivali na smeri genetskih raziskav zaradi svoje zmožnosti samostojne integracije v genom. Diplomska naloga raziskuje vidike uporabe transpozonov v biotehnologiji, predvsem v funkcionalni genomiki in sekvenciranju naslednje generacije (NGS). Predstavljene so metode, kot sta transpozonsko označevanje za ustvarjanje in preučevanje mutacij, vključno z usmerjenim in naključnim označevanjem genov ter tehnikami, kot sta past za ojačevalec in saturacijska mutageneza. Poudarjena je tudi uporaba Tn5 transpozonskega sistema za pripravo knjižnic za NGS, ki je omogočil precejšnjo poenostavitev in pospešitev priprave knjižnic za sekvenciranje. Ta učinkovita fragmentacija DNA in sočasna dodaja adapterjev nista le tehnična izboljšava, temveč sta omogočili razvoj naprednih metod določevanja nukleotidnih zaporedij, kot sta ATAC-seq in ACT-seq za epigenomske analize. Praktični del raziskave je obsegal bioinformatsko analizo de-novo identifikacij ponovljivih elementov v referenčnem genomu navadnega hmelja (Humulus lupulus) z uporabo orodja EDTA pipeline. Rezultati so pokazali, da transpozoni v genomu hmelja predstavljajo izjemnih 84,40 % in potrjujejo ključno vlogo transpozonov pri določanju velikosti rastlinskih genomov.20252025-08-31 07:16:14Diplomsko delo/naloga171705VisID: 261883COBISS_ID: 247365891sl