Tvorba i-motiva DNA iz nukleotidnega zaporedja, modificiranega z 2-aminopurinomŽunec, Lev (Avtor) Lah, Jurij (Mentor) DNAi-motivpH titracijaCD spektroskopijafluorescenčna spektroskopija2-aminopurinMolekula DNA, nosilka genetske informacije, lahko zavzame več različnih strukturnih oblik, poleg Watson-Crickove strukture, B-DNA, lahko ta molekula tvori tudi drugačne sekundarne strukture, med katere spadajo tudi G-kvadrupleksi in i-motivi. Ti dve vrsti struktur sta prisotni predvsem v promotorskih regijah genov, kjer sodelujeta v procesih regulacije genov. V okviru diplomske naloge sem se osredotočil na tvorbo i-motiva iz zaporedja DNA, 5'-CCTTTCCTTT/2-AP/CCTTTCC -3', modificiranega z 2-aminopurinom (2-AP). I-motivi navadno nastanejo iz s citozini bogatih zaporedij, pod pogoji, ki omogočajo protonacijo nekaterih citozinov, kar omogoči nastanek baznih parov C-C$^+$ in nadaljnjo zvitje verige DNA v sekundarno strukturo, imenovano i-motiv. Tvorbo i-motiva sem spremljal z uporabo različnih spektroskopskih metod. Pogoje za tvorbo i-motiva sem ustvaril s postopnim nižanjem pH raztopine z dodatkom klorovodikove kisline (HCl). Opravljeni poskusi pokažejo, da modifikacija zaporedja DNA, v katerem je adenin zamenjan z 2-AP, ne vpliva na zmožnost tvorbe i-motiva. Toplotna denaturacija je, podobno kot pri i-motivu tvorjenem iz nemodificiranega zaporedja, ireverzibilen proces. Pomemben zaključek je, da modifikacija omogoča, spremljanje tvorbe i-motiva tudi s fluorescenčno spektroskopijo, preko emisije 2-AP.20252025-03-24 15:10:01Diplomsko delo/naloga168006VisID: 24292COBISS_ID: 234394371sl