Analiza metabolnega profila celic CHO v bioprocesu z dohranjevanjem v podporo uravnavanju fukozilacije rekombinantnih protitelesLipovšek, Maja (Avtor) Narat, Mojca (Mentor) Curk, Tomaž (Komentor) bioprocesibioinformatikabioinformacijska analizametabolomikafukozilacijacelice CHOmonoklonska protitelesabioproces z dohranjevanjembiološka zdravilaTemelj biofarmacevtike je proizvodnja terapevtskih učinkovin s pomočjo živih organizmov, pri čemer veliko pozornosti posvečamo uravnavanju kakovosti pridobljenega produkta. Eden najpomembnejših atributov kakovosti monoklonskih protiteles (mAb) je fukozilacija, saj močno vpliva na reakcijo celično posredovane citotoksičnosti (ADCC) pri pacientih. Fukozilacijo mAb uravnavamo s spreminjanjem pogojev gojenja rekombinantne celične linije, s čimer usmerjamo celični metabolizem v želeno smer procesiranja produkta. Namen doktorskega dela je bil poglobiti razumevanje celičnega procesa fukozilacije v trajni celični liniji ovarijskih celic kitajskega hrčka (CHO), ki se v biofarmacevtski industriji najpogosteje uporabljajo za proizvodnjo bioloških zdravil. Med bioprocesom z dohranjevanjem smo merili znotrajcelične metabolite in opravili bioinformacijske analize metabolomskih podatkov. Izvedli smo petnajst 14-dnevnih bioprocesov z dohranjevanjem, pri katerih smo poleg zunajceličnih metabolitov izolirali in merili tudi znotrajcelične metabolite, ki sestavljajo metabolom. Metabolomske podatke smo analizirali s kombinacijo univariantne in multivariantne statistike ter specializiranih bioinformacijskih pristopov. Uspešno smo opredelili štiri različne metabolne faze bioprocesa z dohranjevanjem ter poiskali nabor znotrajceličnih metabolitov, ki se statistično značilno razlikujejo med standardnim bioprocesom z dohranjevanjem in tistim, ki je bil optimiziran za pridobivanje večjega deleža fukoziliranih mAb. Tako smo na podlagi izvedenih eksperimentov in bioinformacijskih analiz izboljšali razumevanje metabolnih procesov, ki potekajo v celicah CHO med bioprocesom z dohranjevanjem, in raziskali pogoje, ki omogočajo pridobivanje različno fukoziliranih mAb.20252025-03-21 07:15:50Doktorsko delo/naloga167953VisID: 257177COBISS_ID: 229786627sl