Primerjava učinkovitosti različnih tipov inokuluma za prenos viroida HSVd pri navadni kumari (Cucumis sativus)Rozman, Maj (Avtor) Jakše, Jernej (Mentor) Volk, Helena (Komentor) navadna kumaraviroid HSVdviroid zakrnelosti hmeljainokulacijaRT-PCRKumara (Cucumis sativus) je pomembna kmetijska rastlina, ki jo poleg drugih patogenov ogrožajo tudi razni viroidi, med njimi viroid zakrnelosti hmelja (HSVd). Okužba s HSVd povzroča deformacije, zakrnelo rast in zmanjšanje pridelka, kar predstavlja velik gospodarski problem. Namen magistrske naloge je bil primerjati učinkovitost različnih tipov inokuluma za prenos HSVd pri kumarah ter raziskati možne alternativne vire inokuluma. V okviru poskusa smo pripravili RNA-transkripte v pozitivni in negativni orientaciji, plazmide z zapisom za HSVd ter PCR-produkt z zapisom za HSVd. Dve sorti kumar, 'Suyo' in 'Marketer', smo inokulirali mehansko z različnimi tipi inokuluma, nato pa uspešnost okužbe preverili z metodo RT-PCR in agarozno gelsko elektroforezo. Po teh analizah smo prisotnost viroida potrdili še s sekvenciranjem. Inokulirali smo 50 rastlin vsake sorte. Rezultati so pokazali, da je bila najvišja stopnja okuženosti dosežena pri uporabi RNA-transkripta v pozitivni orientaciji, kjer smo pri obeh sortah dosegli 100 % okužbo. Pri inokulaciji s plazmidom je bila stopnja okuženosti 50 %, medtem ko je bila pri PCR-produktih PCR okuženost 50-% za sorto 'Suyo' in 40-% za sorto 'Marketer'. RNA-transkript v negativni orientaciji je povzročil 30-% okuženost pri obeh sortah.20242024-12-21 07:15:07Magistrsko delo/naloga166134VisID: 255870COBISS_ID: 220198915sl