Analiza izražanja z metilacijo DNA povezanih genov hmelja ob okužbi s CBCVdStopar, Sara (Avtor) Jakše, Jernej (Mentor) Volk, Helena (Komentor) viroidiCBCVdtranskripcijsko utišanje genovmetilacijaV magistrskem delu smo s qPCR preučevali izražanje genov, povezanih z metilacijo DNA, pri hmelju, okuženem z viroidom CBCVd. Hmelj je pomembna kmetijska rastlina, ki jo ogrožajo različni patogeni, med katerimi je okužba s CBCVd še posebej problematična. Osredotočili smo se na gene DRM2, AGO4, CLSY1, RDR2, HEN1 in DCL3, ki so povezani z metilacijo DNA, epigenetskim mehanizmom, s katerimi se rastline hitro prilagajajo na biotske in abiotske dražljaje. Eksperiment smo izvedli na treh sortah hmelja, v treh časovnih točkah po okužbi. Naša hipoteza je bila, da bo izražanje genov različno med okuženimi in neokuženimi rastlinami, pričakovali pa smo povišano izražanje pri okuženih rastlinah, kar bi nakazovalo aktivno metilacijo kot obrambni odziv rastline na okužbo. Rezultati so pokazali statistično značilne razlike v izražanju genov AGO4, HEN1 in DCL3, vendar le v nekaterih časovnih točkah. Presenetljivo je bilo, da je bilo izražanje teh genov višje pri neokuženih rastlinah. Pri sorti Celeia, ki je občutljiva na okužbo, smo pričakovali višje izražanje genov v primerjavi s tolerantnima sortama Styrian Styrian Cardinal in Styrian Styrian Wolf. Statistično značilna razlika v izražanju je bila opažena le pri genu AGO4, kjer je bilo izražanje višje pri domnevno tolerantni sorti Styrian Styrian Wolf, kar nakazuje na kompleksnost odziva rastlin na viroidne okužbe in potrebo po nadaljnjih raziskavah na tem področju.20242024-10-12 07:15:14Magistrsko delo/naloga163839VisID: 248289COBISS_ID: 211352835sl