Določevanje raznolikosti rodu Viola z analizo ribosomalne DNA in merjenjem velikosti genomaJamnik, Polona (Avtor) Rudolf Pilih, Katarina (Mentor) Violavelikost genomavrednost 2Cribosomalna DNAsekvenciranjeRod Viola, ki spada v družino Violaceae, vključuje več kot petsto vrst, razširjenih po svetu, od zmernega pasu severne poloble do tropov in subtropov. Ta rod, prvič opisan v 18. stoletju, vključuje tako enoletne kot trajne zelnate rastline. V nalogi smo bili osredotočeni na morfološke in genetske značilnosti vrst Viola sp., z namenom, da bi bolje razumeli njihovo biotsko raznovrstnost in pripomogli k njihovemu ohranjanju. Morfološke značilnosti, kot so oblika in velikost listov, cvetov in stebel, ter barva cvetov, so ključne za razlikovanje med vrstami. Pri zbranih petdesetih vzorcih različnih vrst smo opravili meritve velikosti genoma s pretočno citometrijo, ki so pokazale, da se velikost genoma med vrstami razlikuje. Najmanjšo povprečno izmerjeno vrednost 2C je imela Viola reichenbachiana Jord ex. Boreau, medtem ko je največjo povprečno vrednost 2C dosegla Viola x wittrockiana. Za analizo ribosomalne DNA je ena glavnih težav prisotnost sekundarnih metabolitov, ki otežujejo izolacijo DNA in nadaljnje analize. Ugotovili smo, da CTAB metoda ni učinkovita pri vseh vrstah, zato so potrebne prilagoditve ali uporaba alternativnih metod. Uspešne PCR reakcije so omogočile določitev nukleotidnih zaporedij ribosomalne DNA 26 vzorcev različnih vrst, ki smo jih primerjali z zbirkami NCBI BLAST. Sekvenciranje ribosomalne DNA je pokazalo, da čeprav je odstotek genetske identitete med vrstami relativno visok, obstajajo značilne variacije, ki omogočajo diferenciacijo med posameznimi vrstami.20242024-09-28 07:15:54Magistrsko delo/naloga162839VisID: 247643COBISS_ID: 210409987sl