Molekularna opredelitev in epidemiološke značilnosti rinovirusov pri bolnikih z akutno okužbo dihalBerginc, Nataša (Avtor) Petrovec, Miroslav (Mentor) Sočan, Maja (Komentor) Picornaviridaerinovirusigenotipizacijaepidemiologijaakutne okužbe dihalRinovirusi so najpogostejši povzročitelji okužb dihal pri ljudeh, zato predstavljajo visoko javnozdravstveno in socioekonomsko breme. Razvoj ukrepov za obvladovanje le-tega omogočajo podatki o kliničnih in epidemioloških lastnostih rinovirusov, ki so omejeni. Cilj longitudinalne molekularno-epidemiološke raziskave je bil pridobiti zadostne, statistično relevantne, znanstvene podatke za celovito opredelitev molekularne epidemiologije rinovirusov. V osemletnem obdobju smo zbrali vzorce zgornjih dihal 20.425 bolnikov z akutno okužbo dihal, iz vseh starostnih skupin, ki so bili obravnavani v primarnem zdravstvu ali v bolnišnicah v okviru nacionalnega programa spremljanja gripi podobnih bolezni in akutnih okužb dihal. Z RT-rPCR smo pri 1834 bolnikih potrdili okužbo z rinovirusi. S filogenetsko analizo nukleotidnega zaporedja za prekurzor beljakovin VP4/VP2 smo 1480 rinovirusov genotipizirali. Informacijo o genotipski raznolikosti smo preučili v povezavi s standardiziranimi demografskimi, kliničnimi, epidemiološkimi in meteorološkimi podatki. Ugotovili smo, da rinovirusi krožijo preko celega leta z različno intenziteto. Natančno smo opisali vsakoletni spomladanski in jesenski val povečanega kroženja ter ugotovili visoko stopnjo genotipske raznolikosti v posameznih valovih. Potrdili smo statistično pomembno korelacijo med genotipsko raznolikostjo rinovirusov in starostjo bolnikov ter med bolniki iz primarnega zdravstva in iz bolnišnic. Potrdili smo negativno korelacijo in statistično pomemben vpliv povprečne temperature zraka na kroženje rinovirusov. Identificirali smo genotipe, za katere z večjo verjetnostjo predpostavljamo, da povzročajo večje javnozdravstveno breme (ker so se pojavljali v največjem deležu, z največjo frekvenco, v vseh starostnih skupinah, izključno pri bolnikih iz bolnišnic). Informacije, ki smo jih pridobili v raziskavi, omogočajo opredelitev molekularne epidemiologije rinovirusov in zagotavljajo izhodišče za razvoj ukrepov za obvladovanje njihovega javnozdravstvenega bremena, kar bi bilo v prihodnje potrebno vezati na integrirano virološko in epidemiološko spremljanje povzročiteljev respiratornih okužb.[N. Berginc]20242024-09-18 07:15:07Doktorsko delo/naloga161967UDK: 578.2:578.835.2:616-036.22VisID: 28091COBISS_ID: 207949315sl