Analiza diferencialnega izražanja genov v človeških osteosarkomskih celicah divjega tipa in z izbitim genom FUBP3Milostnik, Nina (Avtor) Lovšin, Marija Nika (Mentor) Kostni metabolizemosteoporozaosteogena diferenciacijaFUBP3GWAS.Študije asociacije na celotnem genomu (GWAS študije) se uporabljajo za odkrivanje različic na genomu, pri katerih je statistično tveganje za pojavnost določene bolezni višje. Rezultati teh študij pričajo o SNP polimorfizmu v genu FUBP3, ki bi lahko vplival na kostno remodelacijo in bil povezan z nižjo mineralno kostno gostoto in povečanim tveganjem za zlome. Na podlagi rezultatov GWAS študij smo torej FUBP3 opredelili kot potencialno tarčo, ki bi lahko sodelovala v procesih kostnega metabolizma in vplivala na mineralno kostno gostoto. Cilj magistrske naloge je ovrednotiti vpliv gena FUBP3 na kostni metabolizem, saj o njegovem vplivu na tem področju ni še nič znanega. Hipoteze smo postavili na podlagi rezultatov, predhodno pridobljenih na Katedri za klinično biokemijo Fakultete za farmacijo UL. Ugotovljeno je bilo namreč, da je bila v celicah, ki jim je bil gen FUBP3 izbit, motena mineralizacija. Gen FUBP3 smo funkcijsko ovrednotili s pomočjo rezultatov analize diferencialnega izražanja genov MMP-1, VCAM-1, ALPL, CARMIL2, EDNRA, NFATC2, CHI3L1, MCAM in TUBB3. V okviru magistrske naloge smo s pomočjo metode kvantitativne verižne reakcije s polimerazo v realnem času v vzorcu, ki vsebuje človeške osteosarkomske celice, določili nivo izražanja izbranih genov. Nato smo določili nivo izražanja istih genov v celicah, ki jim je bil predhodno izbit gen FUBP3. Ugotavljali smo, kako se koncentracija posamičnega gena v celicah, v katerih je FUBP3 izbit, spremeni v primerjavi s celicami divjega tipa. Na podlagi tega rezultata in v literaturi pridobljenih informacij o tem, kako analizirani geni vplivajo na kostni metabolizem, smo iskali potencialne mehanizme, prek katerih bi lahko FUBP3 vplival na mineralno kostno gostoto. Po interpretaciji rezultatov smo hipoteze, ki smo jih postavili na podlagi rezultatov, pridobljenih na Fakulteti za farmacijo, potrdili, saj se je pri večini rezultatov pokazalo, da je nivo izražanja gena FUBP3 sorazmeren z mineralno kostno gostoto in nanjo vpliva pozitivno, odkrili smo pa tudi potencialne signalne poti, prek katerih bi FUBP3 lahko vplival na mineralno kostno gostoto.20242024-08-31 07:45:13Magistrsko delo/naloga160576VisID: 107324sl