Vpliv krožnih RNA na izražanje genov cirkadianega ritma v celični liniji U2OSResnik, Katja (Avtor) Režen, Tadeja (Mentor) krožne RNA molekulehsa_circ_0000524hsa_circ_0001380cirkadiani ritemKrožne molekule RNA (circRNA) so enoverižne, kovalentno sklenjene ribonukleinske kisline, ki jih uvrščamo v skupino nekodirajočih molekul RNA. Porast števila raziskav na področju krožnih molekul RNA vodi v odkrivanje čedalje več pomembnih funkcij in potencialnih načinov uporabe krožnih molekul RNA v medicini in pri procesih zdravljenja različnih bolezni. Tako se med drugim predvideva, da naj bi bile specifične krožne molekule RNA udeležene v procesih uravnavanja cirkadianega ritma, kar smo se odločili nekoliko podrobneje raziskati v sklopu naloge. Cirkadiani ritem je namreč naravno prisotno nihanje psiholoških, biokemijskih in vedenjskih procesov v organizmu, ki naj bi se periodično ponavljali približno vsakih 24 ur. Z namenom analize vpliva izbranih krožnih molekul RNA na izražanje genov cirkadianega ritma BMAL1, CLOCK, PER1, PER2, CRY1 in CRY2 je bilo v sklopu predhodnih raziskav v celicah celične linije U2OS čezmerno izraženih 11 potencialnih krožnih RNA molekul. Namen moje naloge je bil, potrditi čezmerno izraženost izbranih circRNA, nato pa za dve z največjim potencialnim vplivom na cirkadiani ritem analizirati spremembo v ravni izražanja zgoraj omenjenih genov med celicami, kjer je bila izbrana krožna RNA čezmerno izražena in celicami, ki so bile transficirane s praznim vektorjem pRR (brez vstavljenega zapisa za circRNA), oziroma netransficiranimi celicami, ki jim niso bili dodani niti vektorji, niti reagenti transfekcije. V sklopu eksperimentalnega dela smo tako uspešno potrdili čezmerno izraženost izbranih krožnih molekul RNA v celicah celične linije U2OS, prav tako pa smo uspeli zaznati spremembo v ravni izražanja gena BMAL1 v primeru čezmerne izraženosti circRNA hsa_circ_0001380 in gena PER2 v primeru čezmerne izraženosti circRNA hsa_circ_0000524. Odkrili pa smo tudi vpliv samega praznega vektorja pRR na izražanje genov PER1 in BMAL1.20232023-10-26 14:55:01Diplomsko delo/naloga151981VisID: 22816COBISS_ID: 174529539sl