Določanje podtipov limfocitov T na osnovi podatkov sekvenciranja RNA posameznih celicDebeljak, Tilen (Avtor) Zorc, Minja (Mentor) scRNA-seqtranskriptomlimfociti Tanotacija celicDoločevanje limfocitov T je z razvojem scRNA-seq dobilo nov vpogled v heterogeno sestavo limfocitov T. Pri limfocitih T poznamo več podtipov, ki imajo vsak svojo funkcijo. Iz sestave limfocitov T se lahko razbere bolezensko stanje pacienta. To je uporabno predvsem pri določevanju rakavih obolenj in pri kroničnih okužbah. scRNA-seq je relativno nova tehnologija, zato je še v procesu izpopolnjevanja. Tehnologija scRNA-seq nam omogoča opazovanje transkriptoma posameznih celic v vzorcu. Za izvedbo scRNA-seq so razvili različne protokole. Izziv pri scRNA-seq je velika količina podatkov, ki jih moramo analizirati, kar zahteva visoko računalniško zmogljivost. Na voljo imamo različna programska orodja za analizo. Analiza podatkov se začne s predobdelavo podatkov, pri čemer opravimo kontrolo kakovosti transkriptov in odpravimo neustrezne celice. Temu sledi kvantitativna analiza transkriptoma in kartiranje na referenčni genom. Po predobdelavi podatkov se lahko lotimo analize in vizualizacije podatkov. Opravljene študije so do zdaj dokazale, da s scRNA-seq pri limfocitih T odkrijemo večjo heterogenost podtipov v primerjavi s tradicionalnimi metodami.20232023-09-10 07:17:00Diplomsko delo/naloga149788VisID: 228943COBISS_ID: 164321539sl