RNA stikalo z metiltransferazno aktivnostjoKos Thaler, Nuša (Avtor) Plavec, Janez (Mentor) preQ1 RNA-stikalaNMR spektroskopijam6preQ1Thermoanaerobacter tengcongensisRNA-stikala so nadzorni mRNA-elementi, ki ob vezavi metabolitov spremenijo sekundarno in terciarno strukturo ter s tem vplivajo na uravnavanje izražanja genov. Prekvenozin 1 (preQ1) RNA-stikala so odgovorna za regulacijo biosinteze in transporta preQ1, ki je prekurzor hipermodificiranega gvaninskega nukleotida Q, ki se nahaja na ohlapnih mestih v tRNA-molekulah. Aptamerna domena preQ1 RNA-stikala bakterije T. tengcongensis prepozna tako ligand preQ1 kot tudi modificiran ligand O6-metil prekvenozin (m6preQ1). Vezava slednjega omogoča prenos metilne skupine iz liganda na citozinski ostanek RNA-stikala, kar predstavlja specifično metilacijo RNA ostanka, pri kateri se sprosti ligand preQ1. Metilacija je razširjena posttranskripcijska modifikacija, ki se pojavlja v kodirajočih in nekodirajočih RNA ter vpliva tudi na regulatorno funkcijo stikal. Reakcija prenosa metilne skupine naj bi predstavljala povezavo med sodobnimi RNA-stikali in predbiotskim RNA-svetom, v katerem naj bi RNA-stikala nadzorovala, ribocimi pa katalizirali metabolne reakcije. S pomočjo NMR spektroskopije smo ugotovili, da se ob dodatku metiliranega in nemetliranega liganda inducira zvitje preQ1 RNA-stikala T. tengcongensis. Metiltransferazna reakcija preQ1 RNA-stikala T. tengcongensis z ligandom m6preQ1 je specifična za preQ1 RNA-stikala razreda I in tipa 1. Odkritja RNA-stikal z metiltransferazno aktivnostjo lahko pomagajo pri razvijanju in vivo in in vitro metilacijskih orodij.20232023-08-22 08:50:37Diplomsko delo/naloga148407VisID: 22702COBISS_ID: 162829059sl