Molekularna opredelitev povzročiteljev navadnih kožnih bradavicSkubic, Lucijan (Avtor) Poljak, Mario (Mentor) človeški papilomavirusinavadne kožne bradavicepovzročiteljimolekularna opredelitevvirusno bremeČloveški papilomavirusi (HPV) so etiološko povezani z nastankom številnih benignih kožnih novotvorb, med katerimi so najpogostejše navadne kožne bradavice (verrucae vulgares). Namen naše raziskave je bil, da z različnimi molekularnimi metodami prvič doslej zanesljivo določimo HPV povzročitelja v vsaj 95 % primerov navadnih kožnih bradavic. V sklopu vzpostavljenega diagnostičnega protokola smo z uporabo široko-spektralne verižne reakcije s polimerazo (PCR), sekveniranja po Sangerju in dveh predhodno opisanih ter sedmih novo razvitih tipsko-značilnih kvantitativnih PCR v realnem času (qPCR) v kombinaciji s qPCR za pomnoževanje dela gena za človeški beta-globin testirali 132 histološko-potrjenih navadnih kožnih bradavic in določili etiološko vlogo vseh zaznanih genotipov HPV na podlagi ocene virusnega bremena. Skupno smo kot povzročitelje opredelili 12 različnih genotipov HPV v 126/130 (96,9 %) HPV pozitivnih navadnih kožnih bradavic, med katerimi so prevladovali HPV27 (27,7 %), HPV57 (26,1 %), HPV4 (14,6 %), HPV2 (13,1 %) in HPV65 (7,7 %). Z metagenomskim sekveniranjem naslednje generacije v bradavicah brez uspešne etiološke opredelitve nismo zaznali HPV DNA. S tipsko-značilnimi protokoli digitalnega PCR smo z višjo stopnjo natančnosti kvantifikacije tarčnih genotipov HPV v testiranih bradavicah potrdili enake povzročitelje kot s tipsko-značilnimi qPCR, brez statistično značilnih razlik v vrednostih virusnih bremen med obema metodama, pri čemer je imel vzpostavljen diagnostični protokol širše dinamično območje.[L. Skubic]20232023-08-03 07:15:07Doktorsko delo/naloga148218UDK: 578.72:616-006.5:577.2.083VisID: 24136COBISS_ID: 160473859sl