Odkrivanje ortobunjavirusov in flebovirusov v klopih v SlovenijiKmetič, Petra (Avtor) Avšič Županc, Tatjana (Mentor) Korva, Miša (Komentor) ortobunjavirusiflebovirusiklopiIxodes ricinusNGSfilogenetska analizaKlopi so visoko specializirani obligatni hematofagni ektoparaziti. So pomembni prenašalci patogenov, vključno s številnimi virusi. Rod Orthobunyavirus sodi v družino Peribunyaviridae, Phlebovirus pa je rod virusov, ki spada v družino Phenuiviridae. Oba rodova sodita v red Bunyavirales. Cilj raziskave je bilo ugotoviti ali so ortobunjavirusi ali flebovirusi prisotni v klopih v Sloveniji ter analizirati genetsko raznolikost dokazanih virusov. V raziskavo smo vključili 8515 klopov, ki smo jih ulovili z metodo zastave, na 14 lokacijah po Sloveniji, vsak mesec od aprila 2005 do novembra 2008. Klope smo identificirali in jih razvrstili v skupine, glede na vrsto (Dermacentor reticulatus, Haemaphysalis concinna, Haemaphysalis punctata in Ixodes ricinus), spol, razvojni stadij, lokacijo in datum vzorčenja. Sledila je osamitev RNA iz vzorcev klopov, nato pa smo z molekularnimi metodami in nadaljnjo filogenetsko analizo nukleotidnih zaporedij segmenta L virusnega genoma, dokazali virus Uukuniemi (UUKV) in neuvrščene fleboviruse, ki smo jih dalje razdelili v štiri podskupine, genetsko sorodne z virusoma angl. Norway phlebovirus 1 in angl. Blacklegged tick phlebovirus 1, ki sodita v rod Ixovirus. Flebovirusi se ne razvrščajo v skupine glede na lokacijo vzorčenja. Ortobunjavirusov v klopih nismo dokazali. Prisotnost flebovirusov smo dokazali zgolj med klopi vrste Ixodes ricinus. Dokazali smo, da se prevalence okužbe klopov med različnimi lokacijami razlikujejo. Najpogosteje okužen razvojni stadij je bil odrasel klop.[P. Kmetič]20232023-06-15 08:43:52Magistrsko delo/naloga146844UDK: 578.2:595.421.616.9VisID: 217793COBISS_ID: 155780867sl