Osamitev in molekularna karakterizacija bakterije Clostridioides difficile iz sedimentov različnih vodnih okolijFuks, Alen (Avtor) Rupnik, Maja (Mentor) Štefanič, Polonca (Komentor) C. difficileizolacijakarakterizacijaagarozna elektroforezabiotehnologijatoksinotipizacijaribotipizacijaribotiptoksinotipClostridioides difficile (prej Clostridium difficile) je anaerobna, po Gramu pozitivna bakterija, ki je sposobna tvoriti spore. Najpomembnejši rezervoar bakterije predstavlja črevesje ljudi in živali in pri obojih povzroča tudi črevesne okužbe. Prisotna je tudi v različnih okoljih (bolnišnice, vodna okolja, čistilne naprave, gospodinjstvo, hrana). Namen našega raziskovalnega dela je bil izolacija bakterije C. difficile iz vzorcev sedimentov različnih vodnih okolij na območju vzhodne Slovenije in karakterizacije le-teh z ribotipizacijo in toksinotipizacijo. Vzorčili smo na 15 različnih lokacijah iz šestih različnih tipov stoječih in tekočih vod. V vseh vzorcih smo dokazali prisotnost spor bakterije C. difficile. Vse vzorce smo obdelali z dvema pristopoma, z in brez sonikacije. Skupaj smo osamili 171 izolatov C. difficile, ki so bili razvrščeni v 25 različnih ribotipov in pet različnih toksinotipov. V številu izolatov med obema pristopoma obdelave (sonikacija, brez sonikacije) ni bilo velikih razlik, je pa bila razlika v številu različnih ribotipov, saj smo s sonikacijo našli 22 različnih ribotipov, brez sonikacije le devet. Najpogostejša ribotipa sta bila 001/072 in 014/020, ki sta oba toksigena in pripadata toksinotipu 0. Našli smo tudi nov ribotip, SLO 302, ki je toksigen. Iz dobljenih rezultatov lahko sklepamo, da so sedimenti vodnih okolij pogosto kontaminirani s sporami C. difficile in lahko imajo možno vlogo pri prenosih bakterije.20232023-06-15 08:43:22Magistrsko delo/naloga146840VisID: 217789COBISS_ID: 156804867sl