Analiza energijsko pomembnih interakcij v kompleksih nanotelo-antigenZgonik, Timotej (Avtor) Hadži, San (Mentor) energijsko pomembne interakcijekontaktnanoteloepitopFoldXNanotelesa so proteini izvedeni iz posebne vrste imunoglobulinov, ki imajo samo težko verigo in imajo zaradi tega posebne lastnosti. Dodaten vpogled v način prepoznave antigenov z nanotelesi lahko dobimo z analizo energijsko močnejših interakcij (ang. hot-spot). Za iskanje teh interakcij in silico smo uporabili program FoldX, s katerim lahko izvedemo iskanje z mutacijo aminokislinskih ostankov v alanin in ovrednotimo nastalo spremembo proste energije pri nastanku kompleksa nanotelo-antigen. Na ta način smo našli 652 energijsko močnih interakcij v bazi 123 struktur kompleksov nanotelo-antigen. Ugotovili smo, da aminokislinski ostanek tirozin najpogosteje tvori energijsko močne interakcije, pretežno pa se te nahajajo v področju zanke CDR3. Zdi se tudi, da med številom interakcij in kontaktov ni nikakršne korelacije. Izsledki bi lahko bili eden od korakov za morebitno načrtovanje nanoteles za medicinsko uporabo.20232023-04-03 10:10:09Diplomsko delo/naloga145072VisID: 20841COBISS_ID: 148174851sl