Sinteza in biokemijsko vrednotenje novih kloracetamidnih kovalentnih zaviralcev encima MurAKončan, Blaž (Avtor) Gobec, Stanislav (Mentor) Alternativni antibiotikbakterijska rezistencakovalentni tarčni zaviralecMurApeptidoglikan.Razvoj antibiotikov se zaradi vse večjega pojava bakterijske rezistence in posledično grožnje javnemu zdravju usmerja v razvoj alternativnih antibiotikov. Naraščajoča pojavnost lete je privedla do vse večjega interesa za načrten razvoj kovalentnih tarčnih zaviralcev, ki so v preteklosti zaradi reaktivne strukture in potencialne nespecifičnosti vezave, veljali za neselektivne in zato potencialno toksične. Ta trend so v nasprotno smer premaknila spoznanja, da kot kovalentni zaviralci delujejo že nekatere učinkovine, ki so na trgu že dalj časa. Najbolj znana tarčna kovalentna zaviralca sta namreč acetilsalicilna kislina, ki je na trgu že od leta 1899, ter penicilin, ki je na voljo od leta 1928. Peptidoglikan, ki tvori bakterijsko celično steno, je rigidna struktura sestavljena iz premreženih polimernih verig Nacetilmuraminske kisline in Nacetilglukozamina. Zaradi odsotnosti celične stene v človeških celicah predstavlja odlično tarčo za razvoj novih protibakterijskih učinkovin. S tem namenom smo iz prej pripravljene knjižnice fragmentov, ki so bili virtualno sidrani na aktivno mesto encima MurA, izbrali 14 spojin s potencialnim zaviralnim učinkom na omenjeni encim. Spojine smo pripravili z Naciliranjem kloracetilkloridne bojne glave na ogrodja z različnimi strukturami. Namen uporabe različnih ogrodij je bilo doseči čim večje število dodatnih nekovalentnih interakcij z aktivnim mestom encima, ki bi se izrazile kot nižja inhibitorna koncentracija. Te koncentracije bomo določili z uporabo kolorimetrične metode, kjer bomo s prostim fosfatom, ki nastaja ob normalnem delovanju encima, tvorili obarvan kompleks. Na podlagi pridobljenih absorbanc lahko določimo ali posamezna spojina zavira delovanje encima ter kakšna je koncentracija spojin, ki zavre 50 % delovanja encima (IC50). Ugotovili smo, da spojine 15 na encim učinkujejo zaviralno, z IC50 vrednostmi med 44,4 in 452,4 μmol/L, medtem ko spojina 6 ne izkazuje zaviralnih lastnosti.20232023-02-16 07:45:24Magistrsko delo/naloga144354VisID: 95025sl