Analiza genetske raznolikosti slovenskih akcesij čebule (Allium cepa L.)Doljak, Žiga (Avtor) Jakše, Jernej (Mentor) Pipan, Barbara (Komentor) čebulagenetska raznolikostDNA markerjigenotipizacijaalelni profiliČebula (Allium cepa. L) je dvoletna zelenjadnica iz družine narcisovk (Amaryllidaceae L.). Zaradi njenega velikega pomena na svetovnem trgu, se izvaja vse več znanstvenih raziskav usmerjenih v preučevanje genetske raznolikosti in pridobivanja linij odpornih na zunanje dejavnike. Z uporabo DNA markerjev smo opravili analizo genetske raznolikosti 60 slovenskih akcesij čebule, kjer je bila vsaka od njih zastopana s štirimi individualnimi rastlinami/genotipi, dodatno smo vključili še tri standarde (dve komercialni sorti in en hibrid). Rezultate dominantne in kodominatne genotipizacije smo analizirali in predstavili s pomočjo različnih programov populacijske genetike. Skupno smo 243 genotipov analizirali na 26 DNA lokusih. Najprej smo izvedli kodominantno genotipizacijo z uporabo petih PCR specifičnih in lastnostno vezanih DNA markerjev, s katerimi smo uspešno identificirali fertilno citoplazmo (N), avtoplazemske mutacije na normalni citoplazmi (T) in prisotnost moške sterilne citoplazme v 58 % deležu populacije. V drugem sklopu smo s 15 SSR markerji (angl. Simple Sequence Repeats) in 6 ILP markerji (angl. Intron Length Polymorphism) izvedli alelno genotipizacijo ter analizirali genetsko raznolikost in variabilnost med akcesijami in znotraj njih. Celotna zbirka akcesij se razdeli na tri skupine, kjer je genetska raznolikost največja znotraj druge skupine (Fst = 0,16), najmanjša pa znotraj tretje skupine (Fst = 0,12). Z analizo AMOVA smo ugotovili 34 % raznolikost znotraj genotipov, 39 % med njimi in 27 % med posameznimi akcesijami. Preko izračunane povprečne vrednosti Shannonovega informacijskega indeksa (1,370) in pričakovane heterozigotnosti (0,714) smo ugotovili, da med akcesijami čebule obstaja visoka genetska raznolikost. Gre za prvo tovrstno vrednotenje čebule, ki podaja informacijo o genetskem ozadju, stopnji sorodstva ter splošni genetski raznolikosti slovenskih akcesij čebule.20222022-11-30 07:15:38Magistrsko delo/naloga142853VisID: 216933COBISS_ID: 131679235sl