Poskus izolacije cianofaga iz Blejskega jezera v času množičnega pojavljanja cianobakterije Planktothrix rubescensAndoljšek, Maša (Avtor) Dolinar, Marko (Mentor) Planktothrix rubescenscianobakterijacianofagcvetenjeBlejsko jezeroNa Blejskem jezeru vsakoletno prihaja do cvetenja cianobakterije Planktothrix rubescens. Možnih vzrokov za hitro zmanjšanje koncentracije te cianobakterije po zaključku cvetenja je več; po eni izmed hipotez je vzrok prisotnost cianofaga, ki napade to cianobakterijo. Vzorčili smo površinsko vodo Blejskega jezera od decembra 2020 do aprila 2021, pri čemer smo poskušali zajeti čim večje število alg. Na osnovi genoma edinega cianofaga, katerega genomsko zaporedje poznamo in napade rod Planktothrix, smo pripravili oligonukleotide, ki bi lahko z reakcijo PCR dokazovali prisotnost sorodnega cianofaga v Blejskem jezeru. Prisotnost Planktothrix rubescens v vzorcih smo dokazali z opazovanjem pod mikroskopom. Poskusili smo izolirati posamezen filament cianobakterije z metodo premikanja proti svetlobi, nato pa še z izolacijo posamezne niti v mikrocentrifugirkah. Opazili smo, da se filamenti orientirajo proti svetlobi. Kulturo Planktothrix rubescens smo poskušali vzgojiti v tekočem gojišču BG-11. Z večstopenjsko filtracijo s končno velikostjo por 0,2 μm smo želeli priti do frakcije z obogatenim fagom. Posneli smo UV-VIS spektre in opazovali, kako so se zmanjšale kontaminante med filtracijo. Z metodama verižne reakcije s polimerazo in agarozne gelske elektroforeze smo v okoljskem vzorcu in končnemu filtratu dokazali, da so v vzorcih prisotne cianobakterije. Poleg tega smo z uporabo oligonukleotidov, na osnovi genomskega zaporedja za Planktothrix specifičnega faga, v istih vzorcih dobili pozitiven rezultat pri dokazovanju prisotnosti cianofagov.20222022-06-02 13:20:00Diplomsko delo/naloga137147VisID: 20581COBISS_ID: 110383107sl