Analiza genetske variabilnosti gena IL21 pri kokošiRode, Jerneja (Avtor) Kunej, Tanja (Mentor) Narat, Mojca (Komentor) interlevkin 21genetska variabilnostrazličica nukleotidnega zaporedjaavtoimunske boleznikokošInterlevkin 21 (IL21) je imunomodulatorni citokin, ki deluje na prirojeni in pridobljeni imunski odziv. Povezan je z nastankom različnih bolezenskih stanj. Študije so pokazale, da ima povečanje ali zaviranje aktivnosti IL21 pozitivni učinek pri zdravljenju širokega spektra bolezni. Bolezenska stanja so posledica odstopanja v sintezi/aktivnosti IL21, do katerih lahko pride med drugim tudi zaradi sprememb v zaporedju DNA. Zanimiv model za raziskave IL21 v povezavi z bolezenskimi stanji je kokoš, saj lahko pri tej vrsti v eksperimentalnih, kontroliranih pogojih induciramo avtoimunski artritis z bakterijo Mycoplasma synoviae. Cilj te raziskave je bil preučiti genetsko variabilnost gena IL21 pri kokoši in preveriti, če se te variante nahajajo znotraj regulatornih regij. Določili smo zaporedje dela gena IL21 pri trajni celični liniji kokošjih makrofagov HD-11. Eksperimentalno smo potrdili prisotnost osmih že znanih različic nukleotidnega zaporedja (SNP-jev). Z uporabo bioinformacijskih metod smo napovedali 16 motivov in tri domene v zaporedju proteina, štiri mesta za vezavo mikro RNA ter lokacije in dolžine α-vijačnic. Naredili smo tudi pregled genetskih variant pri človeku, ki so bile povezane z avtoimunskimi boleznimi. Ena se nahaja v regiji, ki ima ortologno zaporedje v genu IL21 pri kokoši, vendar na tej regiji pri kokoši še ni opisanih genetskih variant. Rezultati te študije bodo omogočili nadaljevanje preučevanja gena IL21 pri kokoši in njegove morebitne povezave z nastankom avtoimunskih bolezni.[J. Rode]20222022-03-26 07:15:20Magistrsko delo/naloga135691UDK: 601.4:577.21:575.112:577.27(043.2)VisID: 203378COBISS_ID: 102786819sl