Vzporedni genetski algoritem v OpenCL za simulacijo molekulske dinamikeERENT, TINE (Avtor) Ilc, Nejc (Mentor) Sluga, Davor (Komentor) genetski algoritemOpenCLmolekulska dinamikaV diplomskem delu smo razvili vzporedni genetski algoritem, ki se izvaja na heterogenih računalniških arhitekturah za potrebe simulacije molekulske dinamike. Razviti algoritem uporablja empirično cenilno funkcijo za ocenjevanje rešitev. Simulirali smo sidranje molekul v receptorsko mesto proteina in iskali optimalen položaj molekule. Uporabili smo razvojno ogrodje OpenCL. Analizirali smo konvergenco in učinkovitost algoritma. Uporabljeno merilo učinkovitosti je bil izvajalni čas simulacije. Za testne primere smo uporabili dva liganda. Algoritem smo preizkusili in ovrednotili na dveh grafičnih pospeševalnikih in večjedrnem procesorju. Vzporedni algoritem konvergira in vrača pričakovane rezultate. Za učinkovitejšo rabo grafične procesne enote in večje pohitritve je potrebno algoritem dodatno optimizirati.20222022-03-01 15:20:00Diplomsko delo/naloga135228VisID: 33061COBISS_ID: 99473667sl